Protein–RNA interactions for Protein: Q14134

TRIM29, Tripartite motif-containing protein 29, humanhuman

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM29Q14134 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TRIM29Q14134 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TRIM29Q14134 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TRIM29Q14134 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TRIM29Q14134 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
TRIM29Q14134 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TRIM29Q14134 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TRIM29Q14134 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TRIM29Q14134 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TRIM29Q14134 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TRIM29Q14134 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TRIM29Q14134 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TRIM29Q14134 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TRIM29Q14134 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TRIM29Q14134 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TRIM29Q14134 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TRIM29Q14134 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TRIM29Q14134 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TRIM29Q14134 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TRIM29Q14134 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TRIM29Q14134 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
TRIM29Q14134 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
TRIM29Q14134 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TRIM29Q14134 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TRIM29Q14134 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TRIM29Q14134 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TRIM29Q14134 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TRIM29Q14134 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TRIM29Q14134 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TRIM29Q14134 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TRIM29Q14134 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TRIM29Q14134 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TRIM29Q14134 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TRIM29Q14134 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TRIM29Q14134 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TRIM29Q14134 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TRIM29Q14134 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TRIM29Q14134 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TRIM29Q14134 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TRIM29Q14134 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TRIM29Q14134 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TRIM29Q14134 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TRIM29Q14134 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TRIM29Q14134 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TRIM29Q14134 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
TRIM29Q14134 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TRIM29Q14134 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TRIM29Q14134 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TRIM29Q14134 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TRIM29Q14134 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TRIM29Q14134 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TRIM29Q14134 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TRIM29Q14134 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TRIM29Q14134 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TRIM29Q14134 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TRIM29Q14134 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TRIM29Q14134 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TRIM29Q14134 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TRIM29Q14134 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TRIM29Q14134 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
TRIM29Q14134 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TRIM29Q14134 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TRIM29Q14134 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TRIM29Q14134 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TRIM29Q14134 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TRIM29Q14134 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TRIM29Q14134 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TRIM29Q14134 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TRIM29Q14134 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
TRIM29Q14134 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TRIM29Q14134 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TRIM29Q14134 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TRIM29Q14134 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TRIM29Q14134 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TRIM29Q14134 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TRIM29Q14134 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TRIM29Q14134 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TRIM29Q14134 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TRIM29Q14134 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TRIM29Q14134 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TRIM29Q14134 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TRIM29Q14134 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TRIM29Q14134 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
TRIM29Q14134 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TRIM29Q14134 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TRIM29Q14134 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TRIM29Q14134 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TRIM29Q14134 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TRIM29Q14134 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TRIM29Q14134 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TRIM29Q14134 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TRIM29Q14134 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TRIM29Q14134 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TRIM29Q14134 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TRIM29Q14134 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TRIM29Q14134 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TRIM29Q14134 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TRIM29Q14134 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TRIM29Q14134 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TRIM29Q14134 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
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