Protein–RNA interactions for Protein: Q14003

KCNC3, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 3, humanhuman

Predictions only

Length 757 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC3Q14003 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KCNC3Q14003 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
KCNC3Q14003 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
KCNC3Q14003 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
KCNC3Q14003 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
KCNC3Q14003 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
KCNC3Q14003 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
KCNC3Q14003 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KCNC3Q14003 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
KCNC3Q14003 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KCNC3Q14003 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KCNC3Q14003 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KCNC3Q14003 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KCNC3Q14003 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KCNC3Q14003 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
KCNC3Q14003 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
KCNC3Q14003 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
KCNC3Q14003 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KCNC3Q14003 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
KCNC3Q14003 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KCNC3Q14003 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KCNC3Q14003 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
KCNC3Q14003 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
KCNC3Q14003 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
KCNC3Q14003 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
KCNC3Q14003 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
KCNC3Q14003 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
KCNC3Q14003 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
KCNC3Q14003 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KCNC3Q14003 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KCNC3Q14003 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
KCNC3Q14003 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KCNC3Q14003 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
KCNC3Q14003 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KCNC3Q14003 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
KCNC3Q14003 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KCNC3Q14003 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
KCNC3Q14003 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
KCNC3Q14003 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
KCNC3Q14003 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
KCNC3Q14003 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
KCNC3Q14003 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
KCNC3Q14003 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
KCNC3Q14003 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KCNC3Q14003 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KCNC3Q14003 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
KCNC3Q14003 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
KCNC3Q14003 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
KCNC3Q14003 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
KCNC3Q14003 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
KCNC3Q14003 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
KCNC3Q14003 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
KCNC3Q14003 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
KCNC3Q14003 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
KCNC3Q14003 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
KCNC3Q14003 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
KCNC3Q14003 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
KCNC3Q14003 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
KCNC3Q14003 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KCNC3Q14003 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
KCNC3Q14003 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
KCNC3Q14003 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
KCNC3Q14003 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
KCNC3Q14003 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
KCNC3Q14003 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
KCNC3Q14003 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
KCNC3Q14003 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
KCNC3Q14003 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
KCNC3Q14003 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
KCNC3Q14003 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
KCNC3Q14003 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
KCNC3Q14003 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
KCNC3Q14003 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
KCNC3Q14003 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
KCNC3Q14003 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
KCNC3Q14003 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
KCNC3Q14003 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
KCNC3Q14003 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
KCNC3Q14003 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
KCNC3Q14003 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
KCNC3Q14003 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
KCNC3Q14003 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
KCNC3Q14003 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
KCNC3Q14003 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
KCNC3Q14003 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
KCNC3Q14003 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
KCNC3Q14003 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
KCNC3Q14003 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
KCNC3Q14003 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
KCNC3Q14003 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
KCNC3Q14003 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
KCNC3Q14003 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KCNC3Q14003 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KCNC3Q14003 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KCNC3Q14003 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
KCNC3Q14003 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
KCNC3Q14003 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
KCNC3Q14003 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
KCNC3Q14003 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
KCNC3Q14003 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms