Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

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Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ALCAMQ13740 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ALCAMQ13740 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ALCAMQ13740 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ALCAMQ13740 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ALCAMQ13740 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ALCAMQ13740 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ALCAMQ13740 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ALCAMQ13740 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ALCAMQ13740 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ALCAMQ13740 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ALCAMQ13740 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ALCAMQ13740 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ALCAMQ13740 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ALCAMQ13740 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ALCAMQ13740 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ALCAMQ13740 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27■■□□□ 1.91
ALCAMQ13740 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
ALCAMQ13740 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
ALCAMQ13740 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
ALCAMQ13740 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
ALCAMQ13740 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ALCAMQ13740 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
ALCAMQ13740 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ALCAMQ13740 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ALCAMQ13740 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ALCAMQ13740 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
ALCAMQ13740 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ALCAMQ13740 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ALCAMQ13740 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ALCAMQ13740 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ALCAMQ13740 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ALCAMQ13740 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ALCAMQ13740 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ALCAMQ13740 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ALCAMQ13740 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ALCAMQ13740 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
ALCAMQ13740 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ALCAMQ13740 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ALCAMQ13740 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ALCAMQ13740 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
ALCAMQ13740 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ALCAMQ13740 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ALCAMQ13740 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
ALCAMQ13740 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
ALCAMQ13740 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
ALCAMQ13740 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ALCAMQ13740 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ALCAMQ13740 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ALCAMQ13740 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ALCAMQ13740 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ALCAMQ13740 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ALCAMQ13740 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ALCAMQ13740 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ALCAMQ13740 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ALCAMQ13740 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ALCAMQ13740 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ALCAMQ13740 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ALCAMQ13740 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ALCAMQ13740 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ALCAMQ13740 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ALCAMQ13740 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ALCAMQ13740 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ALCAMQ13740 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ALCAMQ13740 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ALCAMQ13740 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ALCAMQ13740 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ALCAMQ13740 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ALCAMQ13740 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ALCAMQ13740 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ALCAMQ13740 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ALCAMQ13740 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ALCAMQ13740 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
ALCAMQ13740 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ALCAMQ13740 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ALCAMQ13740 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ALCAMQ13740 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ALCAMQ13740 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ALCAMQ13740 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ALCAMQ13740 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ALCAMQ13740 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ALCAMQ13740 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ALCAMQ13740 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
ALCAMQ13740 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ALCAMQ13740 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ALCAMQ13740 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
ALCAMQ13740 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ALCAMQ13740 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ALCAMQ13740 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ALCAMQ13740 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ALCAMQ13740 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ALCAMQ13740 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ALCAMQ13740 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ALCAMQ13740 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ALCAMQ13740 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ALCAMQ13740 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ALCAMQ13740 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ALCAMQ13740 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ALCAMQ13740 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ALCAMQ13740 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
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