Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CUL4BQ13620 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CUL4BQ13620 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CUL4BQ13620 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CUL4BQ13620 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CUL4BQ13620 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CUL4BQ13620 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
CUL4BQ13620 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CUL4BQ13620 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CUL4BQ13620 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CUL4BQ13620 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CUL4BQ13620 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CUL4BQ13620 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CUL4BQ13620 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CUL4BQ13620 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CUL4BQ13620 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CUL4BQ13620 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CUL4BQ13620 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CUL4BQ13620 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CUL4BQ13620 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CUL4BQ13620 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
CUL4BQ13620 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CUL4BQ13620 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CUL4BQ13620 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CUL4BQ13620 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CUL4BQ13620 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CUL4BQ13620 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CUL4BQ13620 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CUL4BQ13620 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CUL4BQ13620 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CUL4BQ13620 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CUL4BQ13620 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CUL4BQ13620 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CUL4BQ13620 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CUL4BQ13620 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
CUL4BQ13620 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CUL4BQ13620 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CUL4BQ13620 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CUL4BQ13620 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CUL4BQ13620 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
CUL4BQ13620 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CUL4BQ13620 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CUL4BQ13620 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
CUL4BQ13620 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CUL4BQ13620 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CUL4BQ13620 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CUL4BQ13620 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CUL4BQ13620 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CUL4BQ13620 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CUL4BQ13620 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CUL4BQ13620 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CUL4BQ13620 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CUL4BQ13620 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CUL4BQ13620 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CUL4BQ13620 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CUL4BQ13620 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CUL4BQ13620 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CUL4BQ13620 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CUL4BQ13620 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CUL4BQ13620 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CUL4BQ13620 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CUL4BQ13620 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CUL4BQ13620 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CUL4BQ13620 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CUL4BQ13620 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CUL4BQ13620 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CUL4BQ13620 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CUL4BQ13620 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CUL4BQ13620 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CUL4BQ13620 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CUL4BQ13620 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CUL4BQ13620 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CUL4BQ13620 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CUL4BQ13620 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CUL4BQ13620 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CUL4BQ13620 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CUL4BQ13620 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CUL4BQ13620 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
CUL4BQ13620 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CUL4BQ13620 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CUL4BQ13620 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CUL4BQ13620 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CUL4BQ13620 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CUL4BQ13620 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
CUL4BQ13620 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CUL4BQ13620 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
CUL4BQ13620 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CUL4BQ13620 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CUL4BQ13620 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CUL4BQ13620 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CUL4BQ13620 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CUL4BQ13620 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CUL4BQ13620 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CUL4BQ13620 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CUL4BQ13620 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CUL4BQ13620 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CUL4BQ13620 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CUL4BQ13620 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CUL4BQ13620 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CUL4BQ13620 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
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