Protein–RNA interactions for Protein: Q13258

PTGDR, Prostaglandin D2 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGDRQ13258 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PTGDRQ13258 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PTGDRQ13258 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PTGDRQ13258 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PTGDRQ13258 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PTGDRQ13258 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PTGDRQ13258 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PTGDRQ13258 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PTGDRQ13258 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PTGDRQ13258 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PTGDRQ13258 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PTGDRQ13258 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PTGDRQ13258 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PTGDRQ13258 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
PTGDRQ13258 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
PTGDRQ13258 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PTGDRQ13258 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PTGDRQ13258 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PTGDRQ13258 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PTGDRQ13258 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PTGDRQ13258 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PTGDRQ13258 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PTGDRQ13258 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PTGDRQ13258 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
PTGDRQ13258 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PTGDRQ13258 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PTGDRQ13258 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PTGDRQ13258 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PTGDRQ13258 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PTGDRQ13258 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PTGDRQ13258 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PTGDRQ13258 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PTGDRQ13258 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PTGDRQ13258 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PTGDRQ13258 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
PTGDRQ13258 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PTGDRQ13258 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PTGDRQ13258 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PTGDRQ13258 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
PTGDRQ13258 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PTGDRQ13258 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PTGDRQ13258 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PTGDRQ13258 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PTGDRQ13258 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PTGDRQ13258 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PTGDRQ13258 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PTGDRQ13258 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PTGDRQ13258 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PTGDRQ13258 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PTGDRQ13258 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
PTGDRQ13258 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PTGDRQ13258 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PTGDRQ13258 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
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PTGDRQ13258 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PTGDRQ13258 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PTGDRQ13258 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PTGDRQ13258 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PTGDRQ13258 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PTGDRQ13258 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PTGDRQ13258 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PTGDRQ13258 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PTGDRQ13258 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PTGDRQ13258 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PTGDRQ13258 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PTGDRQ13258 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PTGDRQ13258 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PTGDRQ13258 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PTGDRQ13258 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PTGDRQ13258 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
PTGDRQ13258 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PTGDRQ13258 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PTGDRQ13258 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PTGDRQ13258 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
PTGDRQ13258 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
PTGDRQ13258 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27.76■■■□□ 2.04
PTGDRQ13258 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
PTGDRQ13258 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PTGDRQ13258 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PTGDRQ13258 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PTGDRQ13258 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PTGDRQ13258 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PTGDRQ13258 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PTGDRQ13258 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PTGDRQ13258 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PTGDRQ13258 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PTGDRQ13258 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PTGDRQ13258 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PTGDRQ13258 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PTGDRQ13258 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PTGDRQ13258 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PTGDRQ13258 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PTGDRQ13258 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PTGDRQ13258 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
PTGDRQ13258 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PTGDRQ13258 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PTGDRQ13258 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PTGDRQ13258 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PTGDRQ13258 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PTGDRQ13258 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
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