Protein–RNA interactions for Protein: Q13129

RLF, Zinc finger protein Rlf, humanhuman

Predictions only

Length 1,914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLFQ13129 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RLFQ13129 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
RLFQ13129 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RLFQ13129 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
RLFQ13129 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.16
RLFQ13129 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
RLFQ13129 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
RLFQ13129 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RLFQ13129 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RLFQ13129 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
RLFQ13129 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RLFQ13129 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
RLFQ13129 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RLFQ13129 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RLFQ13129 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RLFQ13129 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
RLFQ13129 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
RLFQ13129 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
RLFQ13129 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
RLFQ13129 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
RLFQ13129 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RLFQ13129 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RLFQ13129 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RLFQ13129 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
RLFQ13129 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
RLFQ13129 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RLFQ13129 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RLFQ13129 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RLFQ13129 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.15
RLFQ13129 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
RLFQ13129 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
RLFQ13129 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
RLFQ13129 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
RLFQ13129 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
RLFQ13129 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
RLFQ13129 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
RLFQ13129 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RLFQ13129 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
RLFQ13129 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RLFQ13129 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
RLFQ13129 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RLFQ13129 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RLFQ13129 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
RLFQ13129 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RLFQ13129 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RLFQ13129 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RLFQ13129 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
RLFQ13129 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RLFQ13129 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RLFQ13129 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
RLFQ13129 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
RLFQ13129 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
RLFQ13129 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
RLFQ13129 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
RLFQ13129 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
RLFQ13129 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
RLFQ13129 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
RLFQ13129 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RLFQ13129 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
RLFQ13129 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
RLFQ13129 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
RLFQ13129 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RLFQ13129 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RLFQ13129 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
RLFQ13129 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
RLFQ13129 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
RLFQ13129 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RLFQ13129 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RLFQ13129 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RLFQ13129 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RLFQ13129 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
RLFQ13129 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RLFQ13129 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
RLFQ13129 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC28.36■■■□□ 2.13
RLFQ13129 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
RLFQ13129 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
RLFQ13129 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RLFQ13129 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
RLFQ13129 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
RLFQ13129 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
RLFQ13129 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RLFQ13129 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RLFQ13129 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
RLFQ13129 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RLFQ13129 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
RLFQ13129 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
RLFQ13129 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RLFQ13129 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
RLFQ13129 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
RLFQ13129 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
RLFQ13129 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
RLFQ13129 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RLFQ13129 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RLFQ13129 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
RLFQ13129 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
RLFQ13129 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
RLFQ13129 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.12
RLFQ13129 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RLFQ13129 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
RLFQ13129 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms