Protein–RNA interactions for Protein: Q12933

TRAF2, TNF receptor-associated factor 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF2Q12933 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRAF2Q12933 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRAF2Q12933 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRAF2Q12933 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRAF2Q12933 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRAF2Q12933 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRAF2Q12933 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
TRAF2Q12933 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRAF2Q12933 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRAF2Q12933 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
TRAF2Q12933 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRAF2Q12933 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
TRAF2Q12933 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
TRAF2Q12933 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRAF2Q12933 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRAF2Q12933 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRAF2Q12933 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRAF2Q12933 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRAF2Q12933 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRAF2Q12933 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRAF2Q12933 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRAF2Q12933 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRAF2Q12933 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
TRAF2Q12933 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRAF2Q12933 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRAF2Q12933 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRAF2Q12933 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRAF2Q12933 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRAF2Q12933 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRAF2Q12933 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
TRAF2Q12933 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRAF2Q12933 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRAF2Q12933 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRAF2Q12933 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
TRAF2Q12933 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRAF2Q12933 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRAF2Q12933 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRAF2Q12933 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRAF2Q12933 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRAF2Q12933 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRAF2Q12933 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRAF2Q12933 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRAF2Q12933 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRAF2Q12933 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRAF2Q12933 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRAF2Q12933 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRAF2Q12933 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRAF2Q12933 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRAF2Q12933 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRAF2Q12933 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRAF2Q12933 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRAF2Q12933 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRAF2Q12933 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
TRAF2Q12933 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRAF2Q12933 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRAF2Q12933 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRAF2Q12933 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRAF2Q12933 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRAF2Q12933 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRAF2Q12933 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRAF2Q12933 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRAF2Q12933 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRAF2Q12933 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRAF2Q12933 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRAF2Q12933 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRAF2Q12933 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRAF2Q12933 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRAF2Q12933 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRAF2Q12933 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRAF2Q12933 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRAF2Q12933 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRAF2Q12933 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRAF2Q12933 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRAF2Q12933 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRAF2Q12933 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRAF2Q12933 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRAF2Q12933 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRAF2Q12933 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRAF2Q12933 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRAF2Q12933 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRAF2Q12933 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRAF2Q12933 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRAF2Q12933 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRAF2Q12933 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
TRAF2Q12933 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRAF2Q12933 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRAF2Q12933 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRAF2Q12933 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRAF2Q12933 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRAF2Q12933 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRAF2Q12933 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRAF2Q12933 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRAF2Q12933 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRAF2Q12933 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRAF2Q12933 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRAF2Q12933 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRAF2Q12933 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRAF2Q12933 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRAF2Q12933 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRAF2Q12933 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
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