Protein–RNA interactions for Protein: Q12864

CDH17, Cadherin-17, humanhuman

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Length 832 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH17Q12864 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDH17Q12864 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDH17Q12864 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDH17Q12864 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDH17Q12864 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDH17Q12864 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CDH17Q12864 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDH17Q12864 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDH17Q12864 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDH17Q12864 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDH17Q12864 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDH17Q12864 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDH17Q12864 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDH17Q12864 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDH17Q12864 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDH17Q12864 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDH17Q12864 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDH17Q12864 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDH17Q12864 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDH17Q12864 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDH17Q12864 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDH17Q12864 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDH17Q12864 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDH17Q12864 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDH17Q12864 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDH17Q12864 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDH17Q12864 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDH17Q12864 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDH17Q12864 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDH17Q12864 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDH17Q12864 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDH17Q12864 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDH17Q12864 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDH17Q12864 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDH17Q12864 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDH17Q12864 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDH17Q12864 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDH17Q12864 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDH17Q12864 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDH17Q12864 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CDH17Q12864 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDH17Q12864 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDH17Q12864 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDH17Q12864 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDH17Q12864 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDH17Q12864 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDH17Q12864 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDH17Q12864 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CDH17Q12864 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDH17Q12864 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDH17Q12864 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDH17Q12864 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDH17Q12864 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDH17Q12864 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDH17Q12864 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDH17Q12864 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDH17Q12864 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDH17Q12864 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDH17Q12864 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDH17Q12864 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDH17Q12864 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CDH17Q12864 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDH17Q12864 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDH17Q12864 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDH17Q12864 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDH17Q12864 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDH17Q12864 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDH17Q12864 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CDH17Q12864 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDH17Q12864 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDH17Q12864 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDH17Q12864 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDH17Q12864 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDH17Q12864 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDH17Q12864 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDH17Q12864 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDH17Q12864 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDH17Q12864 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDH17Q12864 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDH17Q12864 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDH17Q12864 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDH17Q12864 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDH17Q12864 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDH17Q12864 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDH17Q12864 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDH17Q12864 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDH17Q12864 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDH17Q12864 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDH17Q12864 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CDH17Q12864 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDH17Q12864 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDH17Q12864 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDH17Q12864 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDH17Q12864 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDH17Q12864 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDH17Q12864 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CDH17Q12864 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CDH17Q12864 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CDH17Q12864 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CDH17Q12864 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
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