Protein–RNA interactions for Protein: Q01780

EXOSC10, Exosome component 10, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 885 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC10Q01780 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
EXOSC10Q01780 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
EXOSC10Q01780 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
EXOSC10Q01780 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
EXOSC10Q01780 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
EXOSC10Q01780 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
EXOSC10Q01780 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
EXOSC10Q01780 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
EXOSC10Q01780 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
EXOSC10Q01780 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
EXOSC10Q01780 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
EXOSC10Q01780 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
EXOSC10Q01780 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
EXOSC10Q01780 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
EXOSC10Q01780 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
EXOSC10Q01780 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
EXOSC10Q01780 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
EXOSC10Q01780 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC29■■■□□ 2.23
EXOSC10Q01780 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
EXOSC10Q01780 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
EXOSC10Q01780 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
EXOSC10Q01780 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
EXOSC10Q01780 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
EXOSC10Q01780 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
EXOSC10Q01780 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
EXOSC10Q01780 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
EXOSC10Q01780 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
EXOSC10Q01780 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
EXOSC10Q01780 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
EXOSC10Q01780 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
EXOSC10Q01780 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
EXOSC10Q01780 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
EXOSC10Q01780 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
EXOSC10Q01780 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
EXOSC10Q01780 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
EXOSC10Q01780 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
EXOSC10Q01780 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
EXOSC10Q01780 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
EXOSC10Q01780 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
EXOSC10Q01780 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
EXOSC10Q01780 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
EXOSC10Q01780 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
EXOSC10Q01780 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
EXOSC10Q01780 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
EXOSC10Q01780 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
EXOSC10Q01780 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
EXOSC10Q01780 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
EXOSC10Q01780 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
EXOSC10Q01780 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
EXOSC10Q01780 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
EXOSC10Q01780 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
EXOSC10Q01780 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
EXOSC10Q01780 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
EXOSC10Q01780 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
EXOSC10Q01780 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
EXOSC10Q01780 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
EXOSC10Q01780 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
EXOSC10Q01780 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
EXOSC10Q01780 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
EXOSC10Q01780 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
EXOSC10Q01780 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
EXOSC10Q01780 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
EXOSC10Q01780 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
EXOSC10Q01780 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
EXOSC10Q01780 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
EXOSC10Q01780 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
EXOSC10Q01780 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
EXOSC10Q01780 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
EXOSC10Q01780 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
EXOSC10Q01780 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
EXOSC10Q01780 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
EXOSC10Q01780 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
EXOSC10Q01780 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
EXOSC10Q01780 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
EXOSC10Q01780 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
EXOSC10Q01780 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
EXOSC10Q01780 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
EXOSC10Q01780 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
EXOSC10Q01780 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
EXOSC10Q01780 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
EXOSC10Q01780 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
EXOSC10Q01780 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
EXOSC10Q01780 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
EXOSC10Q01780 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
EXOSC10Q01780 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
EXOSC10Q01780 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
EXOSC10Q01780 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
EXOSC10Q01780 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
EXOSC10Q01780 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
EXOSC10Q01780 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
EXOSC10Q01780 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
EXOSC10Q01780 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
EXOSC10Q01780 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
EXOSC10Q01780 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
EXOSC10Q01780 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.2
EXOSC10Q01780 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC28.83■■■□□ 2.2
EXOSC10Q01780 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
EXOSC10Q01780 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
EXOSC10Q01780 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
EXOSC10Q01780 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.2 ms