Protein–RNA interactions for Protein: P63244

RACK1, Receptor of activated protein C kinase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RACK1P63244 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RACK1P63244 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RACK1P63244 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RACK1P63244 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RACK1P63244 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RACK1P63244 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RACK1P63244 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RACK1P63244 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RACK1P63244 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RACK1P63244 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
RACK1P63244 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RACK1P63244 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RACK1P63244 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RACK1P63244 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RACK1P63244 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RACK1P63244 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RACK1P63244 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RACK1P63244 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RACK1P63244 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RACK1P63244 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RACK1P63244 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
RACK1P63244 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RACK1P63244 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RACK1P63244 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RACK1P63244 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RACK1P63244 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RACK1P63244 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RACK1P63244 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RACK1P63244 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RACK1P63244 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RACK1P63244 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RACK1P63244 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RACK1P63244 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RACK1P63244 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RACK1P63244 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RACK1P63244 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RACK1P63244 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RACK1P63244 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RACK1P63244 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RACK1P63244 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RACK1P63244 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RACK1P63244 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RACK1P63244 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RACK1P63244 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
RACK1P63244 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RACK1P63244 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RACK1P63244 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RACK1P63244 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RACK1P63244 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RACK1P63244 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RACK1P63244 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RACK1P63244 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RACK1P63244 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RACK1P63244 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RACK1P63244 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RACK1P63244 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
RACK1P63244 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RACK1P63244 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RACK1P63244 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RACK1P63244 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RACK1P63244 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RACK1P63244 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
RACK1P63244 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RACK1P63244 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RACK1P63244 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RACK1P63244 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RACK1P63244 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RACK1P63244 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RACK1P63244 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RACK1P63244 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RACK1P63244 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RACK1P63244 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
RACK1P63244 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RACK1P63244 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RACK1P63244 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
RACK1P63244 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RACK1P63244 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RACK1P63244 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RACK1P63244 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RACK1P63244 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RACK1P63244 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RACK1P63244 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RACK1P63244 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RACK1P63244 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RACK1P63244 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RACK1P63244 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RACK1P63244 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RACK1P63244 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RACK1P63244 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RACK1P63244 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RACK1P63244 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RACK1P63244 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RACK1P63244 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RACK1P63244 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RACK1P63244 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
RACK1P63244 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RACK1P63244 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RACK1P63244 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RACK1P63244 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RACK1P63244 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms