Protein–RNA interactions for Protein: P62310

LSM3, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSM3P62310 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
LSM3P62310 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LSM3P62310 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LSM3P62310 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LSM3P62310 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LSM3P62310 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
LSM3P62310 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LSM3P62310 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LSM3P62310 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LSM3P62310 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LSM3P62310 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LSM3P62310 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LSM3P62310 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LSM3P62310 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LSM3P62310 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LSM3P62310 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22■■□□□ 1.11
LSM3P62310 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LSM3P62310 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LSM3P62310 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LSM3P62310 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LSM3P62310 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LSM3P62310 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LSM3P62310 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LSM3P62310 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LSM3P62310 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LSM3P62310 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LSM3P62310 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LSM3P62310 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LSM3P62310 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LSM3P62310 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LSM3P62310 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LSM3P62310 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LSM3P62310 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LSM3P62310 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LSM3P62310 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LSM3P62310 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LSM3P62310 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LSM3P62310 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LSM3P62310 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LSM3P62310 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LSM3P62310 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LSM3P62310 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LSM3P62310 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LSM3P62310 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LSM3P62310 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LSM3P62310 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
LSM3P62310 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LSM3P62310 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LSM3P62310 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LSM3P62310 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LSM3P62310 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LSM3P62310 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LSM3P62310 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LSM3P62310 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LSM3P62310 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LSM3P62310 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LSM3P62310 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LSM3P62310 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LSM3P62310 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LSM3P62310 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LSM3P62310 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LSM3P62310 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LSM3P62310 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LSM3P62310 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LSM3P62310 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LSM3P62310 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LSM3P62310 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LSM3P62310 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LSM3P62310 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
LSM3P62310 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LSM3P62310 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LSM3P62310 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LSM3P62310 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LSM3P62310 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
LSM3P62310 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LSM3P62310 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LSM3P62310 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LSM3P62310 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LSM3P62310 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LSM3P62310 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LSM3P62310 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LSM3P62310 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LSM3P62310 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LSM3P62310 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LSM3P62310 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LSM3P62310 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LSM3P62310 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LSM3P62310 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LSM3P62310 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LSM3P62310 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LSM3P62310 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LSM3P62310 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LSM3P62310 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LSM3P62310 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LSM3P62310 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LSM3P62310 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LSM3P62310 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LSM3P62310 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LSM3P62310 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LSM3P62310 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 191.5 ms