Protein–RNA interactions for Protein: P58512

LINC01547, Uncharacterized protein encoded by LINC01547, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01547P58512 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC01547P58512 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC01547P58512 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC01547P58512 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC01547P58512 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC01547P58512 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LINC01547P58512 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
LINC01547P58512 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
LINC01547P58512 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LINC01547P58512 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC01547P58512 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC01547P58512 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC01547P58512 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC01547P58512 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC01547P58512 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC01547P58512 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC01547P58512 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC01547P58512 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC01547P58512 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC01547P58512 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC01547P58512 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC01547P58512 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC01547P58512 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC01547P58512 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC01547P58512 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC01547P58512 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC01547P58512 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC01547P58512 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC01547P58512 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC01547P58512 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC01547P58512 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC01547P58512 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC01547P58512 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC01547P58512 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC01547P58512 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC01547P58512 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC01547P58512 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC01547P58512 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC01547P58512 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC01547P58512 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC01547P58512 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC01547P58512 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC01547P58512 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC01547P58512 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC01547P58512 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC01547P58512 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC01547P58512 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC01547P58512 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC01547P58512 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC01547P58512 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC01547P58512 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC01547P58512 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC01547P58512 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC01547P58512 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC01547P58512 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC01547P58512 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC01547P58512 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC01547P58512 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC01547P58512 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC01547P58512 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC01547P58512 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC01547P58512 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC01547P58512 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC01547P58512 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC01547P58512 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC01547P58512 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
LINC01547P58512 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
LINC01547P58512 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC01547P58512 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC01547P58512 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC01547P58512 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC01547P58512 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC01547P58512 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC01547P58512 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC01547P58512 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC01547P58512 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC01547P58512 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC01547P58512 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC01547P58512 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC01547P58512 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC01547P58512 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC01547P58512 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC01547P58512 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC01547P58512 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC01547P58512 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC01547P58512 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC01547P58512 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC01547P58512 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC01547P58512 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC01547P58512 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC01547P58512 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC01547P58512 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC01547P58512 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC01547P58512 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC01547P58512 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC01547P58512 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC01547P58512 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC01547P58512 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC01547P58512 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC01547P58512 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms