Protein–RNA interactions for Protein: P57727

TMPRSS3, Transmembrane protease serine 3, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS3P57727 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMPRSS3P57727 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMPRSS3P57727 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMPRSS3P57727 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMPRSS3P57727 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TMPRSS3P57727 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMPRSS3P57727 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMPRSS3P57727 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMPRSS3P57727 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMPRSS3P57727 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMPRSS3P57727 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMPRSS3P57727 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMPRSS3P57727 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMPRSS3P57727 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMPRSS3P57727 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TMPRSS3P57727 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMPRSS3P57727 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMPRSS3P57727 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMPRSS3P57727 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMPRSS3P57727 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMPRSS3P57727 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMPRSS3P57727 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TMPRSS3P57727 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TMPRSS3P57727 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
TMPRSS3P57727 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TMPRSS3P57727 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMPRSS3P57727 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMPRSS3P57727 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMPRSS3P57727 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMPRSS3P57727 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMPRSS3P57727 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMPRSS3P57727 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMPRSS3P57727 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TMPRSS3P57727 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMPRSS3P57727 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TMPRSS3P57727 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMPRSS3P57727 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMPRSS3P57727 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMPRSS3P57727 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMPRSS3P57727 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMPRSS3P57727 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMPRSS3P57727 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMPRSS3P57727 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMPRSS3P57727 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TMPRSS3P57727 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMPRSS3P57727 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMPRSS3P57727 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMPRSS3P57727 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TMPRSS3P57727 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMPRSS3P57727 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMPRSS3P57727 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMPRSS3P57727 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMPRSS3P57727 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMPRSS3P57727 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMPRSS3P57727 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMPRSS3P57727 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
TMPRSS3P57727 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMPRSS3P57727 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMPRSS3P57727 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMPRSS3P57727 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMPRSS3P57727 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMPRSS3P57727 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMPRSS3P57727 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMPRSS3P57727 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMPRSS3P57727 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMPRSS3P57727 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMPRSS3P57727 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMPRSS3P57727 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMPRSS3P57727 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMPRSS3P57727 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMPRSS3P57727 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMPRSS3P57727 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMPRSS3P57727 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMPRSS3P57727 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMPRSS3P57727 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMPRSS3P57727 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMPRSS3P57727 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMPRSS3P57727 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMPRSS3P57727 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TMPRSS3P57727 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMPRSS3P57727 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMPRSS3P57727 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMPRSS3P57727 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMPRSS3P57727 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMPRSS3P57727 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMPRSS3P57727 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMPRSS3P57727 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMPRSS3P57727 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
TMPRSS3P57727 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMPRSS3P57727 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMPRSS3P57727 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
TMPRSS3P57727 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMPRSS3P57727 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMPRSS3P57727 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMPRSS3P57727 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMPRSS3P57727 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMPRSS3P57727 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMPRSS3P57727 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMPRSS3P57727 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TMPRSS3P57727 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms