Protein–RNA interactions for Protein: P53814

SMTN, Smoothelin, humanhuman

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMTNP53814 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SMTNP53814 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SMTNP53814 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SMTNP53814 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SMTNP53814 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
SMTNP53814 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
SMTNP53814 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SMTNP53814 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
SMTNP53814 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SMTNP53814 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SMTNP53814 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
SMTNP53814 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
SMTNP53814 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SMTNP53814 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
SMTNP53814 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SMTNP53814 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SMTNP53814 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SMTNP53814 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SMTNP53814 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SMTNP53814 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SMTNP53814 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SMTNP53814 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SMTNP53814 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SMTNP53814 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SMTNP53814 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SMTNP53814 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SMTNP53814 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SMTNP53814 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SMTNP53814 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
SMTNP53814 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SMTNP53814 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SMTNP53814 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SMTNP53814 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
SMTNP53814 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SMTNP53814 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SMTNP53814 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SMTNP53814 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SMTNP53814 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SMTNP53814 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SMTNP53814 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SMTNP53814 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
SMTNP53814 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SMTNP53814 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SMTNP53814 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SMTNP53814 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SMTNP53814 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SMTNP53814 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SMTNP53814 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SMTNP53814 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SMTNP53814 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SMTNP53814 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SMTNP53814 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SMTNP53814 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SMTNP53814 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SMTNP53814 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SMTNP53814 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SMTNP53814 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SMTNP53814 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SMTNP53814 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SMTNP53814 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SMTNP53814 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SMTNP53814 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SMTNP53814 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
SMTNP53814 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
SMTNP53814 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SMTNP53814 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SMTNP53814 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SMTNP53814 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SMTNP53814 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SMTNP53814 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SMTNP53814 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SMTNP53814 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SMTNP53814 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SMTNP53814 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SMTNP53814 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SMTNP53814 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SMTNP53814 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SMTNP53814 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SMTNP53814 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SMTNP53814 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SMTNP53814 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SMTNP53814 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SMTNP53814 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SMTNP53814 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SMTNP53814 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SMTNP53814 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SMTNP53814 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SMTNP53814 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SMTNP53814 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SMTNP53814 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SMTNP53814 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
SMTNP53814 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SMTNP53814 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SMTNP53814 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SMTNP53814 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SMTNP53814 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SMTNP53814 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.95■■□□□ 1.91
SMTNP53814 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
SMTNP53814 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
SMTNP53814 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms