Protein–RNA interactions for Protein: P53677

AP3M2, AP-3 complex subunit mu-2, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3M2P53677 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
AP3M2P53677 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
AP3M2P53677 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
AP3M2P53677 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
AP3M2P53677 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
AP3M2P53677 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
AP3M2P53677 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
AP3M2P53677 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
AP3M2P53677 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
AP3M2P53677 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
AP3M2P53677 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
AP3M2P53677 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
AP3M2P53677 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
AP3M2P53677 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
AP3M2P53677 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
AP3M2P53677 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
AP3M2P53677 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
AP3M2P53677 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
AP3M2P53677 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
AP3M2P53677 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
AP3M2P53677 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
AP3M2P53677 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
AP3M2P53677 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
AP3M2P53677 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
AP3M2P53677 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
AP3M2P53677 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
AP3M2P53677 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
AP3M2P53677 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
AP3M2P53677 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.49■■□□□ 1.83
AP3M2P53677 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
AP3M2P53677 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
AP3M2P53677 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
AP3M2P53677 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
AP3M2P53677 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
AP3M2P53677 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
AP3M2P53677 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
AP3M2P53677 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
AP3M2P53677 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
AP3M2P53677 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
AP3M2P53677 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
AP3M2P53677 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
AP3M2P53677 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
AP3M2P53677 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
AP3M2P53677 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
AP3M2P53677 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
AP3M2P53677 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
AP3M2P53677 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
AP3M2P53677 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
AP3M2P53677 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
AP3M2P53677 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
AP3M2P53677 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
AP3M2P53677 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
AP3M2P53677 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
AP3M2P53677 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
AP3M2P53677 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.44■■□□□ 1.82
AP3M2P53677 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
AP3M2P53677 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
AP3M2P53677 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
AP3M2P53677 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
AP3M2P53677 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
AP3M2P53677 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
AP3M2P53677 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
AP3M2P53677 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
AP3M2P53677 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
AP3M2P53677 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
AP3M2P53677 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
AP3M2P53677 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
AP3M2P53677 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
AP3M2P53677 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
AP3M2P53677 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
AP3M2P53677 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
AP3M2P53677 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
AP3M2P53677 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
AP3M2P53677 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
AP3M2P53677 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
AP3M2P53677 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
AP3M2P53677 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
AP3M2P53677 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
AP3M2P53677 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
AP3M2P53677 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
AP3M2P53677 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
AP3M2P53677 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
AP3M2P53677 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
AP3M2P53677 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
AP3M2P53677 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
AP3M2P53677 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
AP3M2P53677 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
AP3M2P53677 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
AP3M2P53677 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
AP3M2P53677 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
AP3M2P53677 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.37■■□□□ 1.81
AP3M2P53677 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
AP3M2P53677 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
AP3M2P53677 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
AP3M2P53677 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
AP3M2P53677 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
AP3M2P53677 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
AP3M2P53677 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
AP3M2P53677 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
AP3M2P53677 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71 ms