Protein–RNA interactions for Protein: P52655

GTF2A1, Transcription initiation factor IIA subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A1P52655 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GTF2A1P52655 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GTF2A1P52655 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GTF2A1P52655 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GTF2A1P52655 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GTF2A1P52655 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
GTF2A1P52655 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GTF2A1P52655 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GTF2A1P52655 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GTF2A1P52655 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GTF2A1P52655 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GTF2A1P52655 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GTF2A1P52655 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GTF2A1P52655 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GTF2A1P52655 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GTF2A1P52655 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GTF2A1P52655 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GTF2A1P52655 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GTF2A1P52655 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GTF2A1P52655 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GTF2A1P52655 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GTF2A1P52655 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GTF2A1P52655 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GTF2A1P52655 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GTF2A1P52655 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GTF2A1P52655 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GTF2A1P52655 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GTF2A1P52655 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GTF2A1P52655 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GTF2A1P52655 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
GTF2A1P52655 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GTF2A1P52655 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GTF2A1P52655 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GTF2A1P52655 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GTF2A1P52655 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GTF2A1P52655 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GTF2A1P52655 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GTF2A1P52655 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GTF2A1P52655 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GTF2A1P52655 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GTF2A1P52655 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GTF2A1P52655 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
GTF2A1P52655 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GTF2A1P52655 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GTF2A1P52655 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GTF2A1P52655 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GTF2A1P52655 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GTF2A1P52655 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
GTF2A1P52655 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GTF2A1P52655 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GTF2A1P52655 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GTF2A1P52655 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GTF2A1P52655 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GTF2A1P52655 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GTF2A1P52655 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GTF2A1P52655 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
GTF2A1P52655 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GTF2A1P52655 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GTF2A1P52655 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GTF2A1P52655 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GTF2A1P52655 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GTF2A1P52655 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GTF2A1P52655 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GTF2A1P52655 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GTF2A1P52655 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GTF2A1P52655 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GTF2A1P52655 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GTF2A1P52655 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GTF2A1P52655 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GTF2A1P52655 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GTF2A1P52655 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GTF2A1P52655 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GTF2A1P52655 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GTF2A1P52655 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GTF2A1P52655 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GTF2A1P52655 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GTF2A1P52655 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
GTF2A1P52655 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
GTF2A1P52655 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
GTF2A1P52655 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GTF2A1P52655 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GTF2A1P52655 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GTF2A1P52655 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GTF2A1P52655 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GTF2A1P52655 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GTF2A1P52655 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GTF2A1P52655 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GTF2A1P52655 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GTF2A1P52655 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GTF2A1P52655 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GTF2A1P52655 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GTF2A1P52655 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GTF2A1P52655 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GTF2A1P52655 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GTF2A1P52655 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GTF2A1P52655 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GTF2A1P52655 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GTF2A1P52655 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GTF2A1P52655 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GTF2A1P52655 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms