Protein–RNA interactions for Protein: P51884

LUM, Lumican, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LUMP51884 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
LUMP51884 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
LUMP51884 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
LUMP51884 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
LUMP51884 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
LUMP51884 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
LUMP51884 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
LUMP51884 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
LUMP51884 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
LUMP51884 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
LUMP51884 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
LUMP51884 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
LUMP51884 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
LUMP51884 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
LUMP51884 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
LUMP51884 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
LUMP51884 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
LUMP51884 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
LUMP51884 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
LUMP51884 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
LUMP51884 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
LUMP51884 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
LUMP51884 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
LUMP51884 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
LUMP51884 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
LUMP51884 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
LUMP51884 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
LUMP51884 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
LUMP51884 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LUMP51884 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
LUMP51884 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LUMP51884 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LUMP51884 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LUMP51884 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LUMP51884 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LUMP51884 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LUMP51884 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LUMP51884 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LUMP51884 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LUMP51884 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LUMP51884 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LUMP51884 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LUMP51884 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LUMP51884 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LUMP51884 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
LUMP51884 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LUMP51884 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LUMP51884 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LUMP51884 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
LUMP51884 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LUMP51884 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LUMP51884 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LUMP51884 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LUMP51884 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LUMP51884 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LUMP51884 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
LUMP51884 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LUMP51884 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LUMP51884 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LUMP51884 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LUMP51884 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LUMP51884 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LUMP51884 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LUMP51884 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
LUMP51884 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LUMP51884 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LUMP51884 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
LUMP51884 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LUMP51884 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LUMP51884 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LUMP51884 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
LUMP51884 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LUMP51884 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
LUMP51884 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
LUMP51884 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LUMP51884 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LUMP51884 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
LUMP51884 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
LUMP51884 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LUMP51884 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LUMP51884 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LUMP51884 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LUMP51884 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LUMP51884 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LUMP51884 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LUMP51884 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LUMP51884 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LUMP51884 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
LUMP51884 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LUMP51884 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LUMP51884 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LUMP51884 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LUMP51884 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
LUMP51884 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
LUMP51884 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
LUMP51884 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LUMP51884 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LUMP51884 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LUMP51884 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LUMP51884 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms