Protein–RNA interactions for Protein: P51168

SCNN1B, Amiloride-sensitive sodium channel subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCNN1BP51168 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SCNN1BP51168 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SCNN1BP51168 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SCNN1BP51168 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SCNN1BP51168 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SCNN1BP51168 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SCNN1BP51168 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SCNN1BP51168 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SCNN1BP51168 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SCNN1BP51168 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SCNN1BP51168 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SCNN1BP51168 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SCNN1BP51168 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SCNN1BP51168 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SCNN1BP51168 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
SCNN1BP51168 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SCNN1BP51168 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SCNN1BP51168 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SCNN1BP51168 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SCNN1BP51168 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SCNN1BP51168 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SCNN1BP51168 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SCNN1BP51168 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SCNN1BP51168 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SCNN1BP51168 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SCNN1BP51168 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SCNN1BP51168 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SCNN1BP51168 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SCNN1BP51168 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SCNN1BP51168 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SCNN1BP51168 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SCNN1BP51168 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SCNN1BP51168 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SCNN1BP51168 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SCNN1BP51168 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SCNN1BP51168 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SCNN1BP51168 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
SCNN1BP51168 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SCNN1BP51168 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SCNN1BP51168 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SCNN1BP51168 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SCNN1BP51168 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SCNN1BP51168 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SCNN1BP51168 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SCNN1BP51168 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SCNN1BP51168 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SCNN1BP51168 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SCNN1BP51168 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SCNN1BP51168 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SCNN1BP51168 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SCNN1BP51168 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SCNN1BP51168 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SCNN1BP51168 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SCNN1BP51168 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SCNN1BP51168 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SCNN1BP51168 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SCNN1BP51168 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SCNN1BP51168 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SCNN1BP51168 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SCNN1BP51168 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SCNN1BP51168 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SCNN1BP51168 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SCNN1BP51168 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SCNN1BP51168 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SCNN1BP51168 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCNN1BP51168 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCNN1BP51168 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCNN1BP51168 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCNN1BP51168 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCNN1BP51168 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SCNN1BP51168 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SCNN1BP51168 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SCNN1BP51168 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SCNN1BP51168 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SCNN1BP51168 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SCNN1BP51168 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SCNN1BP51168 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SCNN1BP51168 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCNN1BP51168 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCNN1BP51168 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCNN1BP51168 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCNN1BP51168 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCNN1BP51168 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SCNN1BP51168 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SCNN1BP51168 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SCNN1BP51168 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SCNN1BP51168 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SCNN1BP51168 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SCNN1BP51168 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SCNN1BP51168 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SCNN1BP51168 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SCNN1BP51168 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SCNN1BP51168 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SCNN1BP51168 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SCNN1BP51168 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SCNN1BP51168 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SCNN1BP51168 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SCNN1BP51168 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SCNN1BP51168 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SCNN1BP51168 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms