Protein–RNA interactions for Protein: P45974

USP5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP5P45974 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
USP5P45974 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
USP5P45974 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
USP5P45974 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
USP5P45974 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
USP5P45974 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
USP5P45974 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
USP5P45974 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
USP5P45974 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
USP5P45974 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
USP5P45974 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
USP5P45974 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
USP5P45974 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
USP5P45974 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
USP5P45974 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
USP5P45974 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
USP5P45974 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
USP5P45974 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
USP5P45974 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
USP5P45974 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
USP5P45974 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
USP5P45974 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
USP5P45974 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.29
USP5P45974 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC29.39■■■□□ 2.29
USP5P45974 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
USP5P45974 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
USP5P45974 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
USP5P45974 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
USP5P45974 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
USP5P45974 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
USP5P45974 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
USP5P45974 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
USP5P45974 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
USP5P45974 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
USP5P45974 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
USP5P45974 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
USP5P45974 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
USP5P45974 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC29.36■■■□□ 2.29
USP5P45974 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
USP5P45974 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
USP5P45974 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
USP5P45974 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
USP5P45974 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
USP5P45974 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
USP5P45974 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
USP5P45974 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
USP5P45974 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
USP5P45974 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
USP5P45974 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
USP5P45974 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
USP5P45974 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
USP5P45974 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
USP5P45974 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
USP5P45974 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
USP5P45974 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
USP5P45974 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
USP5P45974 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
USP5P45974 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
USP5P45974 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
USP5P45974 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
USP5P45974 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
USP5P45974 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
USP5P45974 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
USP5P45974 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC29.31■■■□□ 2.28
USP5P45974 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
USP5P45974 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
USP5P45974 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
USP5P45974 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
USP5P45974 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
USP5P45974 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
USP5P45974 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
USP5P45974 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
USP5P45974 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
USP5P45974 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
USP5P45974 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
USP5P45974 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
USP5P45974 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
USP5P45974 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
USP5P45974 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
USP5P45974 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
USP5P45974 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
USP5P45974 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
USP5P45974 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
USP5P45974 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
USP5P45974 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
USP5P45974 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
USP5P45974 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
USP5P45974 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
USP5P45974 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
USP5P45974 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
USP5P45974 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
USP5P45974 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
USP5P45974 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
USP5P45974 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
USP5P45974 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
USP5P45974 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
USP5P45974 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
USP5P45974 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
USP5P45974 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
USP5P45974 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms