Protein–RNA interactions for Protein: P41273

TNFSF9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF9P41273 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TNFSF9P41273 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TNFSF9P41273 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TNFSF9P41273 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TNFSF9P41273 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TNFSF9P41273 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TNFSF9P41273 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TNFSF9P41273 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TNFSF9P41273 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TNFSF9P41273 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
TNFSF9P41273 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TNFSF9P41273 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TNFSF9P41273 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TNFSF9P41273 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TNFSF9P41273 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TNFSF9P41273 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TNFSF9P41273 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
TNFSF9P41273 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
TNFSF9P41273 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TNFSF9P41273 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TNFSF9P41273 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TNFSF9P41273 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TNFSF9P41273 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TNFSF9P41273 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TNFSF9P41273 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TNFSF9P41273 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TNFSF9P41273 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TNFSF9P41273 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TNFSF9P41273 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TNFSF9P41273 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TNFSF9P41273 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TNFSF9P41273 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
TNFSF9P41273 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TNFSF9P41273 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TNFSF9P41273 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TNFSF9P41273 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TNFSF9P41273 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TNFSF9P41273 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TNFSF9P41273 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TNFSF9P41273 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TNFSF9P41273 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TNFSF9P41273 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TNFSF9P41273 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TNFSF9P41273 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TNFSF9P41273 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TNFSF9P41273 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TNFSF9P41273 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
TNFSF9P41273 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
TNFSF9P41273 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TNFSF9P41273 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TNFSF9P41273 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TNFSF9P41273 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
TNFSF9P41273 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TNFSF9P41273 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TNFSF9P41273 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TNFSF9P41273 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TNFSF9P41273 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
TNFSF9P41273 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
TNFSF9P41273 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TNFSF9P41273 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TNFSF9P41273 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
TNFSF9P41273 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
TNFSF9P41273 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TNFSF9P41273 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TNFSF9P41273 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TNFSF9P41273 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
TNFSF9P41273 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TNFSF9P41273 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TNFSF9P41273 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TNFSF9P41273 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
TNFSF9P41273 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TNFSF9P41273 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TNFSF9P41273 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TNFSF9P41273 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TNFSF9P41273 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TNFSF9P41273 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TNFSF9P41273 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TNFSF9P41273 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TNFSF9P41273 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TNFSF9P41273 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TNFSF9P41273 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TNFSF9P41273 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
TNFSF9P41273 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TNFSF9P41273 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TNFSF9P41273 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TNFSF9P41273 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TNFSF9P41273 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TNFSF9P41273 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TNFSF9P41273 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TNFSF9P41273 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TNFSF9P41273 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TNFSF9P41273 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TNFSF9P41273 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TNFSF9P41273 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
TNFSF9P41273 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TNFSF9P41273 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TNFSF9P41273 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
TNFSF9P41273 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TNFSF9P41273 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.84
TNFSF9P41273 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms