Protein–RNA interactions for Protein: P40938

RFC3, Replication factor C subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFC3P40938 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RFC3P40938 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RFC3P40938 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RFC3P40938 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RFC3P40938 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RFC3P40938 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RFC3P40938 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RFC3P40938 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RFC3P40938 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RFC3P40938 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RFC3P40938 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RFC3P40938 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RFC3P40938 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RFC3P40938 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RFC3P40938 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RFC3P40938 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RFC3P40938 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RFC3P40938 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RFC3P40938 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RFC3P40938 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RFC3P40938 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RFC3P40938 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RFC3P40938 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RFC3P40938 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RFC3P40938 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RFC3P40938 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RFC3P40938 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RFC3P40938 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RFC3P40938 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RFC3P40938 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RFC3P40938 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RFC3P40938 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RFC3P40938 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RFC3P40938 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RFC3P40938 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RFC3P40938 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RFC3P40938 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RFC3P40938 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RFC3P40938 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RFC3P40938 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
RFC3P40938 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RFC3P40938 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RFC3P40938 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RFC3P40938 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RFC3P40938 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RFC3P40938 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RFC3P40938 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RFC3P40938 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RFC3P40938 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RFC3P40938 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RFC3P40938 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RFC3P40938 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RFC3P40938 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
RFC3P40938 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RFC3P40938 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RFC3P40938 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RFC3P40938 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RFC3P40938 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RFC3P40938 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RFC3P40938 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RFC3P40938 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RFC3P40938 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RFC3P40938 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RFC3P40938 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RFC3P40938 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RFC3P40938 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RFC3P40938 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RFC3P40938 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RFC3P40938 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RFC3P40938 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RFC3P40938 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RFC3P40938 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RFC3P40938 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RFC3P40938 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RFC3P40938 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RFC3P40938 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RFC3P40938 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RFC3P40938 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RFC3P40938 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RFC3P40938 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RFC3P40938 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RFC3P40938 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RFC3P40938 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RFC3P40938 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RFC3P40938 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RFC3P40938 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RFC3P40938 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RFC3P40938 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RFC3P40938 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RFC3P40938 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RFC3P40938 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RFC3P40938 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RFC3P40938 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RFC3P40938 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RFC3P40938 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RFC3P40938 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RFC3P40938 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RFC3P40938 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RFC3P40938 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RFC3P40938 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms