Protein–RNA interactions for Protein: P35499

SCN4A, Sodium channel protein type 4 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN4AP35499 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
SCN4AP35499 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
SCN4AP35499 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
SCN4AP35499 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
SCN4AP35499 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
SCN4AP35499 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
SCN4AP35499 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
SCN4AP35499 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.37
SCN4AP35499 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
SCN4AP35499 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
SCN4AP35499 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
SCN4AP35499 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
SCN4AP35499 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
SCN4AP35499 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
SCN4AP35499 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
SCN4AP35499 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
SCN4AP35499 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
SCN4AP35499 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
SCN4AP35499 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
SCN4AP35499 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SCN4AP35499 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SCN4AP35499 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
SCN4AP35499 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
SCN4AP35499 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SCN4AP35499 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
SCN4AP35499 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
SCN4AP35499 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
SCN4AP35499 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
SCN4AP35499 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
SCN4AP35499 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
SCN4AP35499 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
SCN4AP35499 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
SCN4AP35499 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SCN4AP35499 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SCN4AP35499 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
SCN4AP35499 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SCN4AP35499 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
SCN4AP35499 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SCN4AP35499 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
SCN4AP35499 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
SCN4AP35499 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
SCN4AP35499 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
SCN4AP35499 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
SCN4AP35499 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
SCN4AP35499 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
SCN4AP35499 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
SCN4AP35499 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
SCN4AP35499 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
SCN4AP35499 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
SCN4AP35499 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
SCN4AP35499 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
SCN4AP35499 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
SCN4AP35499 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC29.78■■■□□ 2.36
SCN4AP35499 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
SCN4AP35499 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
SCN4AP35499 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
SCN4AP35499 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
SCN4AP35499 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
SCN4AP35499 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
SCN4AP35499 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC29.76■■■□□ 2.35
SCN4AP35499 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
SCN4AP35499 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
SCN4AP35499 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
SCN4AP35499 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
SCN4AP35499 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
SCN4AP35499 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
SCN4AP35499 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
SCN4AP35499 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
SCN4AP35499 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SCN4AP35499 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SCN4AP35499 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
SCN4AP35499 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SCN4AP35499 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
SCN4AP35499 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
SCN4AP35499 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
SCN4AP35499 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
SCN4AP35499 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
SCN4AP35499 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
SCN4AP35499 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
SCN4AP35499 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
SCN4AP35499 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
SCN4AP35499 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SCN4AP35499 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SCN4AP35499 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
SCN4AP35499 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SCN4AP35499 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SCN4AP35499 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
SCN4AP35499 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
SCN4AP35499 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
SCN4AP35499 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
SCN4AP35499 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SCN4AP35499 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
SCN4AP35499 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SCN4AP35499 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SCN4AP35499 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
SCN4AP35499 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
SCN4AP35499 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
SCN4AP35499 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
SCN4AP35499 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC29.64■■■□□ 2.34
SCN4AP35499 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.1 ms