Protein–RNA interactions for Protein: P35247

SFTPD, Pulmonary surfactant-associated protein D, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPDP35247 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SFTPDP35247 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SFTPDP35247 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SFTPDP35247 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SFTPDP35247 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SFTPDP35247 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SFTPDP35247 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SFTPDP35247 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SFTPDP35247 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SFTPDP35247 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SFTPDP35247 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SFTPDP35247 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SFTPDP35247 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SFTPDP35247 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SFTPDP35247 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SFTPDP35247 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SFTPDP35247 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SFTPDP35247 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SFTPDP35247 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SFTPDP35247 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SFTPDP35247 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SFTPDP35247 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SFTPDP35247 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SFTPDP35247 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SFTPDP35247 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SFTPDP35247 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SFTPDP35247 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SFTPDP35247 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SFTPDP35247 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SFTPDP35247 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SFTPDP35247 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SFTPDP35247 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SFTPDP35247 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SFTPDP35247 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SFTPDP35247 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SFTPDP35247 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SFTPDP35247 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
SFTPDP35247 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SFTPDP35247 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SFTPDP35247 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SFTPDP35247 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SFTPDP35247 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SFTPDP35247 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SFTPDP35247 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SFTPDP35247 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SFTPDP35247 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SFTPDP35247 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SFTPDP35247 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SFTPDP35247 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SFTPDP35247 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SFTPDP35247 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SFTPDP35247 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SFTPDP35247 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SFTPDP35247 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SFTPDP35247 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SFTPDP35247 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SFTPDP35247 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SFTPDP35247 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SFTPDP35247 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SFTPDP35247 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SFTPDP35247 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SFTPDP35247 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SFTPDP35247 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SFTPDP35247 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SFTPDP35247 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SFTPDP35247 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SFTPDP35247 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SFTPDP35247 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SFTPDP35247 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SFTPDP35247 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SFTPDP35247 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SFTPDP35247 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SFTPDP35247 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SFTPDP35247 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SFTPDP35247 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SFTPDP35247 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SFTPDP35247 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SFTPDP35247 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SFTPDP35247 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SFTPDP35247 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SFTPDP35247 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SFTPDP35247 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SFTPDP35247 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SFTPDP35247 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SFTPDP35247 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SFTPDP35247 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SFTPDP35247 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SFTPDP35247 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SFTPDP35247 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SFTPDP35247 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SFTPDP35247 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SFTPDP35247 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SFTPDP35247 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SFTPDP35247 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SFTPDP35247 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SFTPDP35247 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SFTPDP35247 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SFTPDP35247 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SFTPDP35247 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SFTPDP35247 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms