Protein–RNA interactions for Protein: P34931

HSPA1L, Heat shock 70 kDa protein 1-like, humanhuman

Predictions only

Length 641 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPA1LP34931 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC34.58■■■■□ 3.13
HSPA1LP34931 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC34.58■■■■□ 3.13
HSPA1LP34931 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
HSPA1LP34931 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
HSPA1LP34931 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.12
HSPA1LP34931 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
HSPA1LP34931 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC34.56■■■■□ 3.12
HSPA1LP34931 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
HSPA1LP34931 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
HSPA1LP34931 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC34.55■■■■□ 3.12
HSPA1LP34931 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
HSPA1LP34931 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC34.54■■■■□ 3.12
HSPA1LP34931 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
HSPA1LP34931 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC34.53■■■■□ 3.12
HSPA1LP34931 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC34.53■■■■□ 3.12
HSPA1LP34931 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC34.53■■■■□ 3.12
HSPA1LP34931 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
HSPA1LP34931 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
HSPA1LP34931 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC34.51■■■■□ 3.12
HSPA1LP34931 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
HSPA1LP34931 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.51■■■■□ 3.12
HSPA1LP34931 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC34.5■■■■□ 3.11
HSPA1LP34931 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC34.5■■■■□ 3.11
HSPA1LP34931 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
HSPA1LP34931 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
HSPA1LP34931 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
HSPA1LP34931 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
HSPA1LP34931 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC34.48■■■■□ 3.11
HSPA1LP34931 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
HSPA1LP34931 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
HSPA1LP34931 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
HSPA1LP34931 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC34.47■■■■□ 3.11
HSPA1LP34931 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
HSPA1LP34931 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
HSPA1LP34931 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
HSPA1LP34931 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
HSPA1LP34931 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC34.47■■■■□ 3.11
HSPA1LP34931 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
HSPA1LP34931 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
HSPA1LP34931 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
HSPA1LP34931 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
HSPA1LP34931 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
HSPA1LP34931 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC34.46■■■■□ 3.11
HSPA1LP34931 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
HSPA1LP34931 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC34.46■■■■□ 3.11
HSPA1LP34931 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC34.45■■■■□ 3.11
HSPA1LP34931 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.1
HSPA1LP34931 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
HSPA1LP34931 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
HSPA1LP34931 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
HSPA1LP34931 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
HSPA1LP34931 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
HSPA1LP34931 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
HSPA1LP34931 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
HSPA1LP34931 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
HSPA1LP34931 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
HSPA1LP34931 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
HSPA1LP34931 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
HSPA1LP34931 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
HSPA1LP34931 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
HSPA1LP34931 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
HSPA1LP34931 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
HSPA1LP34931 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
HSPA1LP34931 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
HSPA1LP34931 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
HSPA1LP34931 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
HSPA1LP34931 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
HSPA1LP34931 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
HSPA1LP34931 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
HSPA1LP34931 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
HSPA1LP34931 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC34.37■■■■□ 3.09
HSPA1LP34931 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC34.37■■■■□ 3.09
HSPA1LP34931 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
HSPA1LP34931 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC34.36■■■■□ 3.09
HSPA1LP34931 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC34.36■■■■□ 3.09
HSPA1LP34931 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
HSPA1LP34931 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
HSPA1LP34931 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
HSPA1LP34931 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC34.36■■■■□ 3.09
HSPA1LP34931 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
HSPA1LP34931 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
HSPA1LP34931 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
HSPA1LP34931 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC34.34■■■■□ 3.09
HSPA1LP34931 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
HSPA1LP34931 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
HSPA1LP34931 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
HSPA1LP34931 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
HSPA1LP34931 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.08
HSPA1LP34931 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC34.32■■■■□ 3.08
HSPA1LP34931 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC34.32■■■■□ 3.08
HSPA1LP34931 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
HSPA1LP34931 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
HSPA1LP34931 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
HSPA1LP34931 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
HSPA1LP34931 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
HSPA1LP34931 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
HSPA1LP34931 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC34.29■■■■□ 3.08
HSPA1LP34931 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
HSPA1LP34931 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
HSPA1LP34931 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms