Protein–RNA interactions for Protein: P32926

DSG3, Desmoglein-3, humanhuman

Predictions only

Length 999 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG3P32926 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
DSG3P32926 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
DSG3P32926 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
DSG3P32926 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
DSG3P32926 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
DSG3P32926 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
DSG3P32926 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
DSG3P32926 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
DSG3P32926 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
DSG3P32926 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
DSG3P32926 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
DSG3P32926 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
DSG3P32926 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
DSG3P32926 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
DSG3P32926 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
DSG3P32926 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
DSG3P32926 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
DSG3P32926 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
DSG3P32926 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
DSG3P32926 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
DSG3P32926 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
DSG3P32926 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
DSG3P32926 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
DSG3P32926 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
DSG3P32926 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
DSG3P32926 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
DSG3P32926 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
DSG3P32926 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
DSG3P32926 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC28.44■■■□□ 2.14
DSG3P32926 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
DSG3P32926 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
DSG3P32926 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
DSG3P32926 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
DSG3P32926 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
DSG3P32926 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
DSG3P32926 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
DSG3P32926 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
DSG3P32926 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
DSG3P32926 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
DSG3P32926 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
DSG3P32926 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
DSG3P32926 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
DSG3P32926 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
DSG3P32926 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
DSG3P32926 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
DSG3P32926 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
DSG3P32926 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
DSG3P32926 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
DSG3P32926 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
DSG3P32926 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
DSG3P32926 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
DSG3P32926 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
DSG3P32926 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
DSG3P32926 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
DSG3P32926 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
DSG3P32926 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
DSG3P32926 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
DSG3P32926 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
DSG3P32926 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
DSG3P32926 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
DSG3P32926 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
DSG3P32926 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
DSG3P32926 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
DSG3P32926 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
DSG3P32926 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
DSG3P32926 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
DSG3P32926 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
DSG3P32926 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
DSG3P32926 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
DSG3P32926 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
DSG3P32926 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
DSG3P32926 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
DSG3P32926 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
DSG3P32926 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
DSG3P32926 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
DSG3P32926 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
DSG3P32926 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
DSG3P32926 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
DSG3P32926 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
DSG3P32926 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
DSG3P32926 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
DSG3P32926 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
DSG3P32926 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
DSG3P32926 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
DSG3P32926 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
DSG3P32926 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
DSG3P32926 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
DSG3P32926 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
DSG3P32926 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
DSG3P32926 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
DSG3P32926 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
DSG3P32926 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
DSG3P32926 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
DSG3P32926 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
DSG3P32926 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
DSG3P32926 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
DSG3P32926 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
DSG3P32926 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
DSG3P32926 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
DSG3P32926 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms