Protein–RNA interactions for Protein: P23396

RPS3, 40S ribosomal protein S3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3P23396 CDC123-202ENST00000378900 933 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.538e-8■■■■■ 41.7
RPS3P23396 PLRG1-208ENST00000506918 543 ntTSL 35.17□□□□□ -1.582e-6■■■■■ 41.7
RPS3P23396 CKB-212ENST00000555366 419 ntTSL 212.46□□□□□ -0.417e-11■■■■■ 41.7
RPS3P23396 TSPAN7-207ENST00000488893 736 ntTSL 54.74□□□□□ -1.653e-6■■■■■ 41.6
RPS3P23396 PGK1-203ENST00000476531 960 ntTSL 210.21□□□□□ -0.774e-26■■■■■ 41.6
RPS3P23396 RRM1-211ENST00000532710 549 ntTSL 43.35□□□□□ -1.872e-6■■■■■ 41.5
RPS3P23396 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.131e-9■■■■■ 41.5
RPS3P23396 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.557e-10■■■■■ 41.5
RPS3P23396 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.557e-10■■■■■ 41.5
RPS3P23396 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.027e-10■■■■■ 41.5
RPS3P23396 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.127e-10■■■■■ 41.5
RPS3P23396 PLEKHB2-205ENST00000409279 2488 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.27e-10■■■■■ 41.5
RPS3P23396 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.217e-10■■■■■ 41.5
RPS3P23396 PLEKHB2-202ENST00000403716 4349 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.387e-10■■■■■ 41.5
RPS3P23396 PLEKHB2-208ENST00000439822 4177 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.577e-10■■■■■ 41.5
RPS3P23396 PLEKHB2-201ENST00000234115 4208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.867e-10■■■■■ 41.5
RPS3P23396 RRM1-203ENST00000526350 583 ntTSL 25.19□□□□□ -1.581e-6■■■■■ 41.3
RPS3P23396 ANXA6-212ENST00000521749 880 ntTSL 316.26■□□□□ 0.195e-7■■■■■ 41.3
RPS3P23396 CLTC-204ENST00000472129 654 ntTSL 21.56□□□□□ -2.162e-8■■■■■ 41.3
RPS3P23396 EXOSC7-207ENST00000481405 768 ntTSL 329.12■■■□□ 2.251e-8■■■■■ 41.3
RPS3P23396 EXOSC7-210ENST00000491476 1395 ntTSL 514.09□□□□□ -0.151e-8■■■■■ 41.3
RPS3P23396 EXOSC7-203ENST00000461361 1593 ntTSL 213.95□□□□□ -0.181e-8■■■■■ 41.3
RPS3P23396 EXOSC7-205ENST00000468667 831 ntTSL 511.75□□□□□ -0.531e-8■■■■■ 41.3
RPS3P23396 EXOSC7-201ENST00000265564 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.541e-8■■■■■ 41.3
RPS3P23396 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.185e-13■■■■■ 41.3
RPS3P23396 TCAF1-202ENST00000392900 2513 ntTSL 212.45□□□□□ -0.425e-13■■■■■ 41.3
RPS3P23396 TCAF1-203ENST00000460532 840 ntTSL 29.58□□□□□ -0.885e-13■■■■■ 41.3
RPS3P23396 TCAF1-201ENST00000355951 3343 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.035e-13■■■■■ 41.3
RPS3P23396 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.912e-8■■■■■ 41.2
RPS3P23396 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.32e-8■■■■■ 41.2
RPS3P23396 KCNT1-203ENST00000460750 4738 ntTSL 1 (best)16.39■□□□□ 0.212e-8■■■■■ 41.2
RPS3P23396 KCNT1-215ENST00000631193 991 ntTSL 515.56■□□□□ 0.082e-8■■■■■ 41.2
RPS3P23396 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.082e-8■■■■■ 41.2
RPS3P23396 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.032e-8■■■■■ 41.2
RPS3P23396 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.052e-8■■■■■ 41.2
RPS3P23396 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.12e-8■■■■■ 41.2
RPS3P23396 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.122e-8■■■■■ 41.2
RPS3P23396 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.182e-8■■■■■ 41.2
RPS3P23396 KCNT1-212ENST00000628528 7057 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.232e-8■■■■■ 41.2
RPS3P23396 KCNT1-213ENST00000630792 3606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.342e-8■■■■■ 41.2
RPS3P23396 KCNT1-210ENST00000490363 4065 ntTSL 512.49□□□□□ -0.412e-8■■■■■ 41.2
RPS3P23396 NDUFB5-208ENST00000477177 562 ntTSL 310.23□□□□□ -0.771e-9■■■■■ 41.2
RPS3P23396 AKR1B1-213ENST00000498373 549 ntTSL 29.69□□□□□ -0.864e-6■■■■■ 41.2
RPS3P23396 HACD3-212ENST00000624437 2746 nt8.74□□□□□ -1.014e-6■■■■■ 41.2
RPS3P23396 GPX3-206ENST00000521632 1314 ntTSL 514.76□□□□□ -0.053e-7■■■■■ 40.9
RPS3P23396 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.893e-7■■■■■ 40.9
RPS3P23396 DR1-202ENST00000370272 10148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.553e-7■■■■■ 40.9
RPS3P23396 HSPBP1-203ENST00000585698 557 ntTSL 223.83■■□□□ 1.411e-8■■■■■ 40.9
RPS3P23396 HSPBP1-208ENST00000588971 696 ntTSL 321.56■■□□□ 1.041e-8■■■■■ 40.9
RPS3P23396 HSPBP1-205ENST00000587551 536 ntTSL 216.8■□□□□ 0.281e-8■■■■■ 40.9
RPS3P23396 NDUFB5-206ENST00000473500 689 ntTSL 33.31□□□□□ -1.881e-8■■■■■ 40.8
RPS3P23396 TMEM33-201ENST00000264452 1570 ntTSL 1 (best)19.86■□□□□ 0.771e-7■■■■■ 40.7
RPS3P23396 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.321e-7■■■■■ 40.7
RPS3P23396 COLGALT1-206ENST00000601354 546 ntTSL 511.94□□□□□ -0.51e-14■■■■■ 40.7
RPS3P23396 TMEM33-202ENST00000325094 6221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.671e-7■■■■■ 40.7
RPS3P23396 TMEM33-203ENST00000504986 7482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.761e-7■■■■■ 40.7
RPS3P23396 TMEM33-205ENST00000508448 867 ntTSL 510.15□□□□□ -0.781e-7■■■■■ 40.7
RPS3P23396 SLC2A3-204ENST00000479059 870 ntTSL 25.42□□□□□ -1.542e-7■■■■■ 40.7
RPS3P23396 SLC2A3-206ENST00000490763 943 ntTSL 24.51□□□□□ -1.692e-7■■■■■ 40.7
RPS3P23396 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.611e-6■■■■■ 40.7
RPS3P23396 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.291e-6■■■■■ 40.7
RPS3P23396 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.011e-6■■■■■ 40.7
RPS3P23396 ATP5A1-217ENST00000591981 565 ntTSL 414.29□□□□□ -0.123e-9■■■■■ 40.6
RPS3P23396 ATP5A1-214ENST00000590448 604 ntTSL 212.1□□□□□ -0.473e-9■■■■■ 40.6
RPS3P23396 ATP5A1-219ENST00000592989 553 ntTSL 510.33□□□□□ -0.763e-9■■■■■ 40.6
RPS3P23396 COX6B1-203ENST00000590618 290 ntTSL 36.83□□□□□ -1.326e-15■■■■■ 40.6
RPS3P23396 EMC4-205ENST00000558102 543 ntTSL 215.36■□□□□ 0.054e-7■■■■■ 40.6
RPS3P23396 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.144e-7■■■■■ 40.6
RPS3P23396 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.164e-7■■■■■ 40.6
RPS3P23396 EMC4-206ENST00000558205 1006 ntTSL 214.03□□□□□ -0.164e-7■■■■■ 40.6
RPS3P23396 EMC4-202ENST00000267750 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.024e-7■■■■■ 40.6
RPS3P23396 ASL-209ENST00000493708 885 ntTSL 324.74■■□□□ 1.554e-6■■■■■ 40.5
RPS3P23396 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.397e-9■■■■■ 40.5
RPS3P23396 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.292e-6■■■■■ 40.5
RPS3P23396 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.242e-6■■■■■ 40.5
RPS3P23396 NIPSNAP1-202ENST00000415100 661 ntTSL 522.18■■□□□ 1.144e-8■■■■■ 40.5
RPS3P23396 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.144e-6■■■■■ 40.5
RPS3P23396 PREB-206ENST00000444452 2030 ntTSL 1 (best)22.12■■□□□ 1.132e-6■■■■■ 40.5
RPS3P23396 UBE2H-208ENST00000490974 572 ntTSL 522.07■■□□□ 1.123e-11■■■■■ 40.5
RPS3P23396 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.114e-6■■■■■ 40.5
RPS3P23396 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.074e-8■■■■■ 40.5
RPS3P23396 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.044e-6■■■■■ 40.5
RPS3P23396 CYFIP1-214ENST00000622576 583 ntTSL 421.48■■□□□ 1.034e-6■■■■■ 40.5
RPS3P23396 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.984e-6■■■■■ 40.5
RPS3P23396 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.984e-6■■■■■ 40.5
RPS3P23396 UBE2H-203ENST00000472396 758 ntTSL 521.07■□□□□ 0.963e-11■■■■■ 40.5
RPS3P23396 NAE1-209ENST00000563185 401 ntTSL 520.88■□□□□ 0.934e-6■■■■■ 40.5
RPS3P23396 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.914e-6■■■■■ 40.5
RPS3P23396 NAE1-221ENST00000569388 562 ntTSL 520.68■□□□□ 0.94e-6■■■■■ 40.5
RPS3P23396 POLR2A-206ENST00000576553 602 ntTSL 220.23■□□□□ 0.834e-6■■■■■ 40.5
RPS3P23396 NAE1-213ENST00000564040 536 ntTSL 520.1■□□□□ 0.814e-6■■■■■ 40.5
RPS3P23396 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.784e-6■■■■■ 40.5
RPS3P23396 NAE1-208ENST00000562757 585 ntTSL 219.38■□□□□ 0.694e-6■■■■■ 40.5
RPS3P23396 NAE1-214ENST00000565535 580 ntTSL 519.38■□□□□ 0.694e-6■■■■■ 40.5
RPS3P23396 NAE1-222ENST00000569963 719 ntTSL 219.38■□□□□ 0.694e-6■■■■■ 40.5
RPS3P23396 NAE1-220ENST00000569348 567 ntTSL 419.38■□□□□ 0.694e-6■■■■■ 40.5
RPS3P23396 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.694e-6■■■■■ 40.5
RPS3P23396 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.673e-11■■■■■ 40.5
RPS3P23396 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.664e-6■■■■■ 40.5
RPS3P23396 NAE1-212ENST00000563419 649 ntTSL 418.86■□□□□ 0.614e-6■■■■■ 40.5
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