RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588971.1

HSPBP1-208, Transcript of HSPA (Hsp70) binding protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene HSPBP1, Length 696 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPBP1-208ENST00000588971 NISCHQ9Y2I1 1504 aa53.54■■■■■ 6.16
HSPBP1-208ENST00000588971 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa47.7■■■■■ 5.23
HSPBP1-208ENST00000588971 ABCC9O60706 1549 aa46.56■■■■■ 5.04
HSPBP1-208ENST00000588971 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa44.86■■■■■ 4.77
HSPBP1-208ENST00000588971 NACADO15069 1562 aa44.78■■■■■ 4.76
HSPBP1-208ENST00000588971 DCAF8L2P0C7V8 631 aa44.75■■■■■ 4.75
HSPBP1-208ENST00000588971 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP44.6■■■■■ 4.73
HSPBP1-208ENST00000588971 MYO15BQ96JP2 1530 aa44.49■■■■■ 4.71
HSPBP1-208ENST00000588971 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa44.31■■■■■ 4.68
HSPBP1-208ENST00000588971 UNC13AQ9UPW8 1703 aa43.91■■■■■ 4.62
HSPBP1-208ENST00000588971 SCRIBQ14160 1630 aa43.48■■■■■ 4.55
HSPBP1-208ENST00000588971 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP43.47■■■■■ 4.55
HSPBP1-208ENST00000588971 BICRAQ9NZM4 1560 aa43.44■■■■■ 4.54
HSPBP1-208ENST00000588971 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa43.01■■■■■ 4.48
HSPBP1-208ENST00000588971 DNAJC5BQ9UF47 199 aa42.62■■■■■ 4.41
HSPBP1-208ENST00000588971 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP42.31■■■■■ 4.36
HSPBP1-208ENST00000588971 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa42.16■■■■■ 4.34
HSPBP1-208ENST00000588971 CECR2Q9BXF3 1484 aa41.83■■■■■ 4.29
HSPBP1-208ENST00000588971 SMARCA4P51532 1647 aa41.58■■■■■ 4.25
HSPBP1-208ENST00000588971 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP41.54■■■■■ 4.24
HSPBP1-208ENST00000588971 SMARCA2P51531 1590 aa41.31■■■■■ 4.2
HSPBP1-208ENST00000588971 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa41.29■■■■■ 4.2
HSPBP1-208ENST00000588971 NCAPD3P42695 1498 aa41.27■■■■■ 4.2
HSPBP1-208ENST00000588971 MROH2BQ7Z745 1585 aa41.25■■■■■ 4.19
HSPBP1-208ENST00000588971 PEG3Q9GZU2 1588 aa41.16■■■■■ 4.18
HSPBP1-208ENST00000588971 HMGXB3Q12766 1538 aa41.12■■■■■ 4.17
HSPBP1-208ENST00000588971 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP41.01■■■■■ 4.16
HSPBP1-208ENST00000588971 WIZO95785 1651 aa40.88■■■■■ 4.13
HSPBP1-208ENST00000588971 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP40.76■■■■■ 4.12
HSPBP1-208ENST00000588971 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP40.42■■■■■ 4.06
HSPBP1-208ENST00000588971 NESP48681 1621 aa40.27■■■■■ 4.04
HSPBP1-208ENST00000588971 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa40.26■■■■■ 4.04
HSPBP1-208ENST00000588971 ERCC6Q03468 1493 aa40.18■■■■■ 4.02
HSPBP1-208ENST00000588971 CADPSQ9ULU8 1353 aa40.07■■■■■ 4
HSPBP1-208ENST00000588971 PDS5BQ9NTI5 1447 aa39.95■■■■□ 3.99
HSPBP1-208ENST00000588971 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa39.92■■■■□ 3.98
HSPBP1-208ENST00000588971 CCDC88BA6NC98 1476 aa39.9■■■■□ 3.98
HSPBP1-208ENST00000588971 CFTRP13569 1480 aa39.84■■■■□ 3.97
HSPBP1-208ENST00000588971 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP39.78■■■■□ 3.96
HSPBP1-208ENST00000588971 PRDM2Q13029 1718 aa39.73■■■■□ 3.95
HSPBP1-208ENST00000588971 CUX2O14529 1486 aa39.72■■■■□ 3.95
HSPBP1-208ENST00000588971 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP39.72■■■■□ 3.95
HSPBP1-208ENST00000588971 FANCD2Q9BXW9 1451 aa39.63■■■■□ 3.94
HSPBP1-208ENST00000588971 CEP164Q9UPV0 1460 aa39.62■■■■□ 3.93
HSPBP1-208ENST00000588971 MRC2Q9UBG0 1479 aa39.53■■■■□ 3.92
HSPBP1-208ENST00000588971 WDR62O43379 1518 aa39.4■■■■□ 3.9
HSPBP1-208ENST00000588971 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP39.22■■■■□ 3.87
HSPBP1-208ENST00000588971 ABCC8Q09428 1581 aa39.05■■■■□ 3.84
HSPBP1-208ENST00000588971 TOPBP1Q92547 1522 aa39.01■■■■□ 3.84
HSPBP1-208ENST00000588971 DNMBPQ6XZF7 1577 aa39■■■■□ 3.83
HSPBP1-208ENST00000588971 IFT140Q96RY7 1462 aa38.76■■■■□ 3.8
HSPBP1-208ENST00000588971 CUX1P39880 1505 aa38.7■■■■□ 3.79
HSPBP1-208ENST00000588971 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP38.66■■■■□ 3.78
HSPBP1-208ENST00000588971 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa38.64■■■■□ 3.78
HSPBP1-208ENST00000588971 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP38.6■■■■□ 3.77
HSPBP1-208ENST00000588971 FGD5Q6ZNL6 1462 aa38.59■■■■□ 3.77
HSPBP1-208ENST00000588971 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP38.55■■■■□ 3.76
HSPBP1-208ENST00000588971 SOGA1O94964 1423 aa38.52■■■■□ 3.76
HSPBP1-208ENST00000588971 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa38.48■■■■□ 3.75
HSPBP1-208ENST00000588971 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP38.48■■■■□ 3.75
HSPBP1-208ENST00000588971 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP38.47■■■■□ 3.75
HSPBP1-208ENST00000588971 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa38.45■■■■□ 3.75
HSPBP1-208ENST00000588971 TOP2BQ02880 1626 aa38.43■■■■□ 3.74
HSPBP1-208ENST00000588971 SYNJ1O43426 1573 aa38.4■■■■□ 3.74
HSPBP1-208ENST00000588971 WDR97A6NE52 1622 aa38.34■■■■□ 3.73
HSPBP1-208ENST00000588971 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP38.34■■■■□ 3.73
HSPBP1-208ENST00000588971 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP38.27■■■■□ 3.72
HSPBP1-208ENST00000588971 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa38.21■■■■□ 3.71
HSPBP1-208ENST00000588971 PBRM1Q86U86 1689 aa38.11■■■■□ 3.69
HSPBP1-208ENST00000588971 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa38.09■■■■□ 3.69
HSPBP1-208ENST00000588971 GRIN2BQ13224 1484 aa38.08■■■■□ 3.69
HSPBP1-208ENST00000588971 GAPVD1Q14C86 1478 aa38.08■■■■□ 3.69
HSPBP1-208ENST00000588971 OSCARQ8IYS5 282 aa38.06■■■■□ 3.68
HSPBP1-208ENST00000588971 CHD1O14646 1710 aa38.04■■■■□ 3.68
HSPBP1-208ENST00000588971 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa38.02■■■■□ 3.68
HSPBP1-208ENST00000588971 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP37.98■■■■□ 3.67
HSPBP1-208ENST00000588971 FBLN2P98095 1184 aa37.92■■■■□ 3.66
HSPBP1-208ENST00000588971 SYNJ2O15056 1496 aa37.83■■■■□ 3.65
HSPBP1-208ENST00000588971 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP37.82■■■■□ 3.64
HSPBP1-208ENST00000588971 ERICH3Q5RHP9 1530 aa37.78■■■■□ 3.64
HSPBP1-208ENST00000588971 ADAMTS12P58397 1594 aa37.72■■■■□ 3.63
HSPBP1-208ENST00000588971 KIF27Q86VH2 1401 aa37.68■■■■□ 3.62
HSPBP1-208ENST00000588971 FHAD1B1AJZ9 1412 aa37.63■■■■□ 3.61
HSPBP1-208ENST00000588971 TRIM41Q8WV44 630 aa37.59■■■■□ 3.61
HSPBP1-208ENST00000588971 GRIN2AQ12879 1464 aa37.58■■■■□ 3.61
HSPBP1-208ENST00000588971 CLASP1Q7Z460 1538 aa37.54■■■■□ 3.6
HSPBP1-208ENST00000588971 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa37.5■■■■□ 3.59
HSPBP1-208ENST00000588971 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa37.5■■■■□ 3.59
HSPBP1-208ENST00000588971 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa37.5■■■■□ 3.59
HSPBP1-208ENST00000588971 CUL7Q14999 1698 aa37.5■■■■□ 3.59
HSPBP1-208ENST00000588971 IGF1RP08069 1367 aa37.46■■■■□ 3.59
HSPBP1-208ENST00000588971 ARHGEF11O15085 1522 aa37.46■■■■□ 3.59
HSPBP1-208ENST00000588971 CEP170Q5SW79 1584 aa37.41■■■■□ 3.58
HSPBP1-208ENST00000588971 NUP160Q12769 1436 aa37.38■■■■□ 3.57
HSPBP1-208ENST00000588971 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa37.31■■■■□ 3.56
HSPBP1-208ENST00000588971 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa37.29■■■■□ 3.56
HSPBP1-208ENST00000588971 SHROOM2Q13796 1616 aa37.16■■■■□ 3.54
HSPBP1-208ENST00000588971 ARAP1Q96P48 1450 aa37.13■■■■□ 3.54
HSPBP1-208ENST00000588971 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa37.09■■■■□ 3.53
HSPBP1-208ENST00000588971 CHIC1Q5VXU3 224 aa37.09■■■■□ 3.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.3 ms