Protein–RNA interactions for Protein: P23229

ITGA6, Integrin alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA6P23229 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC30.62■■■□□ 2.49
ITGA6P23229 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
ITGA6P23229 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
ITGA6P23229 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
ITGA6P23229 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
ITGA6P23229 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
ITGA6P23229 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
ITGA6P23229 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
ITGA6P23229 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
ITGA6P23229 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
ITGA6P23229 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
ITGA6P23229 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
ITGA6P23229 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
ITGA6P23229 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
ITGA6P23229 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
ITGA6P23229 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
ITGA6P23229 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
ITGA6P23229 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
ITGA6P23229 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC30.58■■■□□ 2.49
ITGA6P23229 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
ITGA6P23229 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
ITGA6P23229 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
ITGA6P23229 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
ITGA6P23229 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
ITGA6P23229 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
ITGA6P23229 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
ITGA6P23229 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
ITGA6P23229 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
ITGA6P23229 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
ITGA6P23229 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
ITGA6P23229 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
ITGA6P23229 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
ITGA6P23229 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
ITGA6P23229 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
ITGA6P23229 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
ITGA6P23229 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
ITGA6P23229 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
ITGA6P23229 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
ITGA6P23229 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
ITGA6P23229 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
ITGA6P23229 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
ITGA6P23229 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC30.53■■■□□ 2.48
ITGA6P23229 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
ITGA6P23229 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
ITGA6P23229 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
ITGA6P23229 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
ITGA6P23229 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
ITGA6P23229 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
ITGA6P23229 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
ITGA6P23229 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
ITGA6P23229 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
ITGA6P23229 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
ITGA6P23229 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
ITGA6P23229 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
ITGA6P23229 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC30.5■■■□□ 2.47
ITGA6P23229 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
ITGA6P23229 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
ITGA6P23229 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
ITGA6P23229 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
ITGA6P23229 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC30.49■■■□□ 2.47
ITGA6P23229 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
ITGA6P23229 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
ITGA6P23229 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
ITGA6P23229 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
ITGA6P23229 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
ITGA6P23229 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
ITGA6P23229 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
ITGA6P23229 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC30.48■■■□□ 2.47
ITGA6P23229 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC30.47■■■□□ 2.47
ITGA6P23229 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
ITGA6P23229 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC30.46■■■□□ 2.47
ITGA6P23229 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
ITGA6P23229 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
ITGA6P23229 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
ITGA6P23229 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC30.45■■■□□ 2.47
ITGA6P23229 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.46
ITGA6P23229 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
ITGA6P23229 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
ITGA6P23229 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC30.43■■■□□ 2.46
ITGA6P23229 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC30.43■■■□□ 2.46
ITGA6P23229 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
ITGA6P23229 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
ITGA6P23229 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
ITGA6P23229 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
ITGA6P23229 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
ITGA6P23229 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
ITGA6P23229 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
ITGA6P23229 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
ITGA6P23229 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
ITGA6P23229 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
ITGA6P23229 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
ITGA6P23229 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
ITGA6P23229 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
ITGA6P23229 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
ITGA6P23229 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
ITGA6P23229 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
ITGA6P23229 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
ITGA6P23229 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
ITGA6P23229 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
ITGA6P23229 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms