Protein–RNA interactions for Protein: P20700

LMNB1, Lamin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNB1P20700 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
LMNB1P20700 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
LMNB1P20700 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
LMNB1P20700 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC30.39■■■□□ 2.46
LMNB1P20700 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
LMNB1P20700 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
LMNB1P20700 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
LMNB1P20700 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
LMNB1P20700 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
LMNB1P20700 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
LMNB1P20700 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
LMNB1P20700 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
LMNB1P20700 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
LMNB1P20700 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
LMNB1P20700 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC30.35■■■□□ 2.45
LMNB1P20700 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
LMNB1P20700 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
LMNB1P20700 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
LMNB1P20700 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
LMNB1P20700 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
LMNB1P20700 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
LMNB1P20700 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
LMNB1P20700 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
LMNB1P20700 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
LMNB1P20700 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
LMNB1P20700 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
LMNB1P20700 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC30.31■■■□□ 2.44
LMNB1P20700 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
LMNB1P20700 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
LMNB1P20700 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC30.3■■■□□ 2.44
LMNB1P20700 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
LMNB1P20700 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
LMNB1P20700 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
LMNB1P20700 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
LMNB1P20700 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
LMNB1P20700 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
LMNB1P20700 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
LMNB1P20700 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
LMNB1P20700 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
LMNB1P20700 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
LMNB1P20700 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
LMNB1P20700 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
LMNB1P20700 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC30.27■■■□□ 2.44
LMNB1P20700 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
LMNB1P20700 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
LMNB1P20700 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
LMNB1P20700 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
LMNB1P20700 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
LMNB1P20700 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
LMNB1P20700 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
LMNB1P20700 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
LMNB1P20700 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
LMNB1P20700 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
LMNB1P20700 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
LMNB1P20700 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
LMNB1P20700 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC30.25■■■□□ 2.43
LMNB1P20700 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
LMNB1P20700 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC30.25■■■□□ 2.43
LMNB1P20700 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
LMNB1P20700 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
LMNB1P20700 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
LMNB1P20700 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
LMNB1P20700 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
LMNB1P20700 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
LMNB1P20700 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
LMNB1P20700 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
LMNB1P20700 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
LMNB1P20700 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
LMNB1P20700 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
LMNB1P20700 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
LMNB1P20700 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
LMNB1P20700 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
LMNB1P20700 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC30.22■■■□□ 2.43
LMNB1P20700 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
LMNB1P20700 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
LMNB1P20700 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
LMNB1P20700 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.21■■■□□ 2.43
LMNB1P20700 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC30.21■■■□□ 2.43
LMNB1P20700 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
LMNB1P20700 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
LMNB1P20700 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
LMNB1P20700 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
LMNB1P20700 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
LMNB1P20700 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
LMNB1P20700 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
LMNB1P20700 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
LMNB1P20700 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
LMNB1P20700 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
LMNB1P20700 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
LMNB1P20700 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
LMNB1P20700 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
LMNB1P20700 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
LMNB1P20700 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
LMNB1P20700 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
LMNB1P20700 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
LMNB1P20700 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
LMNB1P20700 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
LMNB1P20700 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
LMNB1P20700 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
LMNB1P20700 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 129.8 ms