Protein–RNA interactions for Protein: P13688

CEACAM1, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 1, humanhuman

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEACAM1P13688 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CEACAM1P13688 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CEACAM1P13688 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CEACAM1P13688 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CEACAM1P13688 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CEACAM1P13688 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CEACAM1P13688 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CEACAM1P13688 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CEACAM1P13688 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CEACAM1P13688 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CEACAM1P13688 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CEACAM1P13688 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CEACAM1P13688 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CEACAM1P13688 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CEACAM1P13688 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CEACAM1P13688 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CEACAM1P13688 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CEACAM1P13688 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CEACAM1P13688 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CEACAM1P13688 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CEACAM1P13688 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CEACAM1P13688 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CEACAM1P13688 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CEACAM1P13688 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CEACAM1P13688 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CEACAM1P13688 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CEACAM1P13688 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CEACAM1P13688 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CEACAM1P13688 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CEACAM1P13688 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CEACAM1P13688 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CEACAM1P13688 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CEACAM1P13688 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CEACAM1P13688 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CEACAM1P13688 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CEACAM1P13688 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CEACAM1P13688 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CEACAM1P13688 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CEACAM1P13688 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CEACAM1P13688 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CEACAM1P13688 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CEACAM1P13688 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CEACAM1P13688 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CEACAM1P13688 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CEACAM1P13688 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CEACAM1P13688 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CEACAM1P13688 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CEACAM1P13688 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CEACAM1P13688 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CEACAM1P13688 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CEACAM1P13688 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CEACAM1P13688 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CEACAM1P13688 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CEACAM1P13688 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CEACAM1P13688 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CEACAM1P13688 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CEACAM1P13688 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CEACAM1P13688 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CEACAM1P13688 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CEACAM1P13688 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CEACAM1P13688 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CEACAM1P13688 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CEACAM1P13688 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CEACAM1P13688 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CEACAM1P13688 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CEACAM1P13688 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CEACAM1P13688 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CEACAM1P13688 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CEACAM1P13688 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CEACAM1P13688 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
CEACAM1P13688 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CEACAM1P13688 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CEACAM1P13688 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CEACAM1P13688 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CEACAM1P13688 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CEACAM1P13688 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CEACAM1P13688 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CEACAM1P13688 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CEACAM1P13688 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CEACAM1P13688 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CEACAM1P13688 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CEACAM1P13688 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CEACAM1P13688 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CEACAM1P13688 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CEACAM1P13688 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CEACAM1P13688 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CEACAM1P13688 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CEACAM1P13688 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CEACAM1P13688 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
CEACAM1P13688 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CEACAM1P13688 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CEACAM1P13688 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CEACAM1P13688 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
CEACAM1P13688 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CEACAM1P13688 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CEACAM1P13688 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CEACAM1P13688 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CEACAM1P13688 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CEACAM1P13688 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CEACAM1P13688 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.1 ms