Protein–RNA interactions for Protein: P13591

NCAM1, Neural cell adhesion molecule 1, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAM1P13591 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NCAM1P13591 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NCAM1P13591 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NCAM1P13591 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NCAM1P13591 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NCAM1P13591 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NCAM1P13591 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NCAM1P13591 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NCAM1P13591 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NCAM1P13591 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NCAM1P13591 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NCAM1P13591 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NCAM1P13591 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
NCAM1P13591 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
NCAM1P13591 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NCAM1P13591 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NCAM1P13591 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NCAM1P13591 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NCAM1P13591 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NCAM1P13591 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
NCAM1P13591 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NCAM1P13591 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NCAM1P13591 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NCAM1P13591 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NCAM1P13591 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NCAM1P13591 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NCAM1P13591 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NCAM1P13591 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
NCAM1P13591 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NCAM1P13591 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
NCAM1P13591 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NCAM1P13591 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
NCAM1P13591 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NCAM1P13591 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NCAM1P13591 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NCAM1P13591 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NCAM1P13591 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NCAM1P13591 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NCAM1P13591 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NCAM1P13591 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NCAM1P13591 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NCAM1P13591 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NCAM1P13591 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NCAM1P13591 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NCAM1P13591 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NCAM1P13591 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NCAM1P13591 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NCAM1P13591 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NCAM1P13591 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
NCAM1P13591 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
NCAM1P13591 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
NCAM1P13591 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.69
NCAM1P13591 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
NCAM1P13591 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NCAM1P13591 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NCAM1P13591 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NCAM1P13591 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NCAM1P13591 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NCAM1P13591 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NCAM1P13591 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NCAM1P13591 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NCAM1P13591 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NCAM1P13591 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NCAM1P13591 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NCAM1P13591 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NCAM1P13591 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NCAM1P13591 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NCAM1P13591 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NCAM1P13591 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
NCAM1P13591 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NCAM1P13591 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NCAM1P13591 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NCAM1P13591 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NCAM1P13591 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NCAM1P13591 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NCAM1P13591 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NCAM1P13591 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NCAM1P13591 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NCAM1P13591 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NCAM1P13591 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NCAM1P13591 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NCAM1P13591 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NCAM1P13591 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NCAM1P13591 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NCAM1P13591 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NCAM1P13591 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NCAM1P13591 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NCAM1P13591 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NCAM1P13591 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
NCAM1P13591 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NCAM1P13591 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
NCAM1P13591 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NCAM1P13591 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NCAM1P13591 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NCAM1P13591 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NCAM1P13591 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NCAM1P13591 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NCAM1P13591 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NCAM1P13591 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NCAM1P13591 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.1 ms