Protein–RNA interactions for Protein: P12081

HARS, Histidine--tRNA ligase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HARSP12081 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
HARSP12081 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
HARSP12081 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
HARSP12081 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
HARSP12081 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
HARSP12081 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
HARSP12081 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
HARSP12081 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.85■■□□□ 1.89
HARSP12081 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
HARSP12081 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
HARSP12081 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
HARSP12081 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
HARSP12081 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
HARSP12081 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
HARSP12081 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
HARSP12081 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
HARSP12081 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
HARSP12081 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
HARSP12081 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
HARSP12081 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
HARSP12081 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
HARSP12081 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
HARSP12081 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
HARSP12081 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
HARSP12081 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HARSP12081 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HARSP12081 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
HARSP12081 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
HARSP12081 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
HARSP12081 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
HARSP12081 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
HARSP12081 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HARSP12081 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
HARSP12081 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
HARSP12081 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
HARSP12081 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
HARSP12081 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
HARSP12081 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
HARSP12081 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
HARSP12081 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
HARSP12081 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
HARSP12081 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
HARSP12081 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
HARSP12081 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
HARSP12081 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
HARSP12081 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
HARSP12081 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
HARSP12081 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
HARSP12081 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
HARSP12081 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
HARSP12081 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
HARSP12081 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
HARSP12081 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
HARSP12081 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
HARSP12081 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
HARSP12081 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
HARSP12081 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
HARSP12081 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
HARSP12081 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.76■■□□□ 1.87
HARSP12081 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
HARSP12081 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
HARSP12081 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
HARSP12081 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
HARSP12081 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HARSP12081 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HARSP12081 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HARSP12081 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
HARSP12081 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HARSP12081 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
HARSP12081 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
HARSP12081 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HARSP12081 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HARSP12081 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
HARSP12081 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HARSP12081 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HARSP12081 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HARSP12081 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
HARSP12081 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
HARSP12081 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
HARSP12081 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
HARSP12081 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
HARSP12081 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
HARSP12081 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
HARSP12081 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
HARSP12081 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
HARSP12081 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
HARSP12081 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
HARSP12081 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
HARSP12081 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.72■■□□□ 1.87
HARSP12081 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
HARSP12081 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HARSP12081 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
HARSP12081 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
HARSP12081 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
HARSP12081 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
HARSP12081 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
HARSP12081 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
HARSP12081 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
HARSP12081 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
HARSP12081 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms