Protein–RNA interactions for Protein: P10809

HSPD1, 60 kDa heat shock protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPD1P10809 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
HSPD1P10809 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
HSPD1P10809 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
HSPD1P10809 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
HSPD1P10809 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
HSPD1P10809 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
HSPD1P10809 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
HSPD1P10809 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
HSPD1P10809 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
HSPD1P10809 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
HSPD1P10809 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
HSPD1P10809 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
HSPD1P10809 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
HSPD1P10809 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
HSPD1P10809 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
HSPD1P10809 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
HSPD1P10809 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
HSPD1P10809 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
HSPD1P10809 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
HSPD1P10809 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
HSPD1P10809 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
HSPD1P10809 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
HSPD1P10809 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
HSPD1P10809 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
HSPD1P10809 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
HSPD1P10809 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
HSPD1P10809 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
HSPD1P10809 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
HSPD1P10809 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
HSPD1P10809 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
HSPD1P10809 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
HSPD1P10809 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
HSPD1P10809 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
HSPD1P10809 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC29.36■■■□□ 2.29
HSPD1P10809 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
HSPD1P10809 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
HSPD1P10809 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
HSPD1P10809 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
HSPD1P10809 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
HSPD1P10809 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
HSPD1P10809 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC29.34■■■□□ 2.29
HSPD1P10809 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC29.34■■■□□ 2.29
HSPD1P10809 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
HSPD1P10809 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
HSPD1P10809 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
HSPD1P10809 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
HSPD1P10809 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
HSPD1P10809 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
HSPD1P10809 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
HSPD1P10809 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
HSPD1P10809 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
HSPD1P10809 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
HSPD1P10809 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
HSPD1P10809 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
HSPD1P10809 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
HSPD1P10809 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
HSPD1P10809 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
HSPD1P10809 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
HSPD1P10809 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
HSPD1P10809 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
HSPD1P10809 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC29.31■■■□□ 2.28
HSPD1P10809 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
HSPD1P10809 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
HSPD1P10809 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
HSPD1P10809 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
HSPD1P10809 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
HSPD1P10809 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
HSPD1P10809 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
HSPD1P10809 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
HSPD1P10809 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
HSPD1P10809 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
HSPD1P10809 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
HSPD1P10809 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
HSPD1P10809 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
HSPD1P10809 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
HSPD1P10809 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
HSPD1P10809 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
HSPD1P10809 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
HSPD1P10809 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
HSPD1P10809 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
HSPD1P10809 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
HSPD1P10809 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
HSPD1P10809 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
HSPD1P10809 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC29.26■■■□□ 2.27
HSPD1P10809 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
HSPD1P10809 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
HSPD1P10809 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
HSPD1P10809 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
HSPD1P10809 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
HSPD1P10809 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
HSPD1P10809 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
HSPD1P10809 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
HSPD1P10809 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
HSPD1P10809 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
HSPD1P10809 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
HSPD1P10809 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
HSPD1P10809 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
HSPD1P10809 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
HSPD1P10809 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
HSPD1P10809 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms