Protein–RNA interactions for Protein: P08727

KRT19, Keratin, type I cytoskeletal 19, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT19P08727 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
KRT19P08727 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
KRT19P08727 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
KRT19P08727 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
KRT19P08727 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
KRT19P08727 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
KRT19P08727 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
KRT19P08727 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
KRT19P08727 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
KRT19P08727 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
KRT19P08727 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
KRT19P08727 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
KRT19P08727 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
KRT19P08727 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
KRT19P08727 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
KRT19P08727 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
KRT19P08727 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
KRT19P08727 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
KRT19P08727 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
KRT19P08727 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
KRT19P08727 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
KRT19P08727 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
KRT19P08727 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
KRT19P08727 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
KRT19P08727 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
KRT19P08727 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
KRT19P08727 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
KRT19P08727 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
KRT19P08727 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
KRT19P08727 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
KRT19P08727 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
KRT19P08727 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
KRT19P08727 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
KRT19P08727 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
KRT19P08727 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
KRT19P08727 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
KRT19P08727 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
KRT19P08727 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.45■■□□□ 1.82
KRT19P08727 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
KRT19P08727 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
KRT19P08727 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
KRT19P08727 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
KRT19P08727 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
KRT19P08727 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
KRT19P08727 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
KRT19P08727 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
KRT19P08727 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
KRT19P08727 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
KRT19P08727 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
KRT19P08727 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
KRT19P08727 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
KRT19P08727 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
KRT19P08727 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
KRT19P08727 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
KRT19P08727 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.41■■□□□ 1.82
KRT19P08727 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
KRT19P08727 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
KRT19P08727 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
KRT19P08727 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
KRT19P08727 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
KRT19P08727 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
KRT19P08727 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
KRT19P08727 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
KRT19P08727 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
KRT19P08727 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
KRT19P08727 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
KRT19P08727 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
KRT19P08727 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
KRT19P08727 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
KRT19P08727 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
KRT19P08727 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
KRT19P08727 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
KRT19P08727 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
KRT19P08727 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
KRT19P08727 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
KRT19P08727 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
KRT19P08727 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
KRT19P08727 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
KRT19P08727 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
KRT19P08727 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
KRT19P08727 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
KRT19P08727 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
KRT19P08727 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
KRT19P08727 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.36■■□□□ 1.81
KRT19P08727 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
KRT19P08727 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
KRT19P08727 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
KRT19P08727 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
KRT19P08727 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
KRT19P08727 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
KRT19P08727 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
KRT19P08727 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
KRT19P08727 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
KRT19P08727 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
KRT19P08727 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
KRT19P08727 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
KRT19P08727 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
KRT19P08727 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
KRT19P08727 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
KRT19P08727 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms