Protein–RNA interactions for Protein: P08100

RHO, Rhodopsin, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOP08100 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RHOP08100 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RHOP08100 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RHOP08100 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RHOP08100 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RHOP08100 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RHOP08100 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RHOP08100 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RHOP08100 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RHOP08100 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RHOP08100 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RHOP08100 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RHOP08100 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RHOP08100 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
RHOP08100 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RHOP08100 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RHOP08100 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RHOP08100 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RHOP08100 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RHOP08100 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RHOP08100 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RHOP08100 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RHOP08100 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RHOP08100 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RHOP08100 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RHOP08100 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RHOP08100 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RHOP08100 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RHOP08100 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RHOP08100 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RHOP08100 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RHOP08100 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RHOP08100 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RHOP08100 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
RHOP08100 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RHOP08100 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RHOP08100 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
RHOP08100 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RHOP08100 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
RHOP08100 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RHOP08100 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RHOP08100 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RHOP08100 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RHOP08100 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RHOP08100 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RHOP08100 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RHOP08100 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RHOP08100 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RHOP08100 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RHOP08100 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RHOP08100 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RHOP08100 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RHOP08100 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RHOP08100 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RHOP08100 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RHOP08100 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RHOP08100 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RHOP08100 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
RHOP08100 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RHOP08100 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RHOP08100 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RHOP08100 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RHOP08100 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RHOP08100 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RHOP08100 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RHOP08100 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RHOP08100 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RHOP08100 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RHOP08100 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RHOP08100 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
RHOP08100 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RHOP08100 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
RHOP08100 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
RHOP08100 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RHOP08100 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RHOP08100 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RHOP08100 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RHOP08100 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RHOP08100 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RHOP08100 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RHOP08100 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RHOP08100 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RHOP08100 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RHOP08100 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RHOP08100 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RHOP08100 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RHOP08100 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RHOP08100 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RHOP08100 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RHOP08100 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RHOP08100 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RHOP08100 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RHOP08100 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RHOP08100 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RHOP08100 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RHOP08100 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RHOP08100 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RHOP08100 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RHOP08100 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RHOP08100 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms