Protein–RNA interactions for Protein: O96011

PEX11B, Peroxisomal membrane protein 11B, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX11BO96011 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
PEX11BO96011 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PEX11BO96011 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PEX11BO96011 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PEX11BO96011 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PEX11BO96011 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PEX11BO96011 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PEX11BO96011 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PEX11BO96011 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PEX11BO96011 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PEX11BO96011 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PEX11BO96011 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PEX11BO96011 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PEX11BO96011 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PEX11BO96011 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PEX11BO96011 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PEX11BO96011 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PEX11BO96011 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PEX11BO96011 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PEX11BO96011 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PEX11BO96011 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PEX11BO96011 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PEX11BO96011 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PEX11BO96011 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PEX11BO96011 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PEX11BO96011 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PEX11BO96011 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PEX11BO96011 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PEX11BO96011 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PEX11BO96011 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PEX11BO96011 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PEX11BO96011 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PEX11BO96011 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PEX11BO96011 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PEX11BO96011 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
PEX11BO96011 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PEX11BO96011 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PEX11BO96011 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PEX11BO96011 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PEX11BO96011 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PEX11BO96011 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PEX11BO96011 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PEX11BO96011 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PEX11BO96011 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PEX11BO96011 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PEX11BO96011 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PEX11BO96011 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PEX11BO96011 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PEX11BO96011 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PEX11BO96011 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PEX11BO96011 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PEX11BO96011 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PEX11BO96011 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PEX11BO96011 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PEX11BO96011 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PEX11BO96011 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PEX11BO96011 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PEX11BO96011 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PEX11BO96011 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PEX11BO96011 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PEX11BO96011 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PEX11BO96011 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PEX11BO96011 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PEX11BO96011 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PEX11BO96011 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PEX11BO96011 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PEX11BO96011 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PEX11BO96011 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PEX11BO96011 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PEX11BO96011 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PEX11BO96011 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PEX11BO96011 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PEX11BO96011 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PEX11BO96011 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PEX11BO96011 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PEX11BO96011 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PEX11BO96011 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PEX11BO96011 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PEX11BO96011 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PEX11BO96011 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PEX11BO96011 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
PEX11BO96011 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PEX11BO96011 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PEX11BO96011 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PEX11BO96011 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PEX11BO96011 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PEX11BO96011 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PEX11BO96011 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PEX11BO96011 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PEX11BO96011 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PEX11BO96011 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PEX11BO96011 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PEX11BO96011 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PEX11BO96011 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PEX11BO96011 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PEX11BO96011 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PEX11BO96011 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PEX11BO96011 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PEX11BO96011 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PEX11BO96011 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.9 ms