Protein–RNA interactions for Protein: O94898

LRIG2, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,065 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG2O94898 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LRIG2O94898 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
LRIG2O94898 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
LRIG2O94898 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRIG2O94898 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRIG2O94898 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRIG2O94898 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRIG2O94898 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRIG2O94898 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRIG2O94898 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRIG2O94898 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRIG2O94898 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRIG2O94898 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRIG2O94898 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRIG2O94898 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRIG2O94898 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
LRIG2O94898 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRIG2O94898 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRIG2O94898 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRIG2O94898 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRIG2O94898 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRIG2O94898 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRIG2O94898 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRIG2O94898 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRIG2O94898 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRIG2O94898 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRIG2O94898 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRIG2O94898 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRIG2O94898 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
LRIG2O94898 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LRIG2O94898 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LRIG2O94898 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LRIG2O94898 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LRIG2O94898 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LRIG2O94898 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LRIG2O94898 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LRIG2O94898 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LRIG2O94898 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LRIG2O94898 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LRIG2O94898 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRIG2O94898 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRIG2O94898 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRIG2O94898 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRIG2O94898 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRIG2O94898 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRIG2O94898 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRIG2O94898 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRIG2O94898 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
LRIG2O94898 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRIG2O94898 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRIG2O94898 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
LRIG2O94898 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRIG2O94898 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRIG2O94898 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRIG2O94898 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRIG2O94898 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRIG2O94898 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRIG2O94898 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRIG2O94898 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRIG2O94898 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRIG2O94898 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRIG2O94898 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRIG2O94898 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRIG2O94898 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRIG2O94898 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
LRIG2O94898 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRIG2O94898 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRIG2O94898 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRIG2O94898 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRIG2O94898 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRIG2O94898 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRIG2O94898 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRIG2O94898 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRIG2O94898 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRIG2O94898 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRIG2O94898 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRIG2O94898 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRIG2O94898 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRIG2O94898 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRIG2O94898 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRIG2O94898 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRIG2O94898 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRIG2O94898 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRIG2O94898 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRIG2O94898 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRIG2O94898 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRIG2O94898 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRIG2O94898 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRIG2O94898 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRIG2O94898 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRIG2O94898 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRIG2O94898 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRIG2O94898 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRIG2O94898 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRIG2O94898 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRIG2O94898 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRIG2O94898 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRIG2O94898 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRIG2O94898 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
LRIG2O94898 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms