Protein–RNA interactions for Protein: O94759

TRPM2, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPM2O94759 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
TRPM2O94759 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.91■■■■□ 3.34
TRPM2O94759 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC35.91■■■■□ 3.34
TRPM2O94759 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC35.9■■■■□ 3.34
TRPM2O94759 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
TRPM2O94759 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
TRPM2O94759 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
TRPM2O94759 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
TRPM2O94759 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
TRPM2O94759 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
TRPM2O94759 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC35.89■■■■□ 3.34
TRPM2O94759 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC35.88■■■■□ 3.33
TRPM2O94759 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
TRPM2O94759 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC35.88■■■■□ 3.33
TRPM2O94759 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
TRPM2O94759 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
TRPM2O94759 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC35.87■■■■□ 3.33
TRPM2O94759 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC35.87■■■■□ 3.33
TRPM2O94759 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
TRPM2O94759 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC35.86■■■■□ 3.33
TRPM2O94759 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
TRPM2O94759 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
TRPM2O94759 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
TRPM2O94759 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
TRPM2O94759 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
TRPM2O94759 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC35.83■■■■□ 3.33
TRPM2O94759 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
TRPM2O94759 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.83■■■■□ 3.33
TRPM2O94759 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC35.83■■■■□ 3.33
TRPM2O94759 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC35.83■■■■□ 3.33
TRPM2O94759 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.33
TRPM2O94759 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
TRPM2O94759 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
TRPM2O94759 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC35.82■■■■□ 3.32
TRPM2O94759 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC35.82■■■■□ 3.32
TRPM2O94759 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
TRPM2O94759 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.82■■■■□ 3.32
TRPM2O94759 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC35.81■■■■□ 3.32
TRPM2O94759 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
TRPM2O94759 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.81■■■■□ 3.32
TRPM2O94759 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.8■■■■□ 3.32
TRPM2O94759 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC35.8■■■■□ 3.32
TRPM2O94759 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC35.79■■■■□ 3.32
TRPM2O94759 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC35.79■■■■□ 3.32
TRPM2O94759 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC35.79■■■■□ 3.32
TRPM2O94759 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC35.79■■■■□ 3.32
TRPM2O94759 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
TRPM2O94759 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
TRPM2O94759 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
TRPM2O94759 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
TRPM2O94759 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC35.78■■■■□ 3.32
TRPM2O94759 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
TRPM2O94759 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC35.76■■■■□ 3.32
TRPM2O94759 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
TRPM2O94759 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
TRPM2O94759 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
TRPM2O94759 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.75■■■■□ 3.31
TRPM2O94759 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC35.75■■■■□ 3.31
TRPM2O94759 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
TRPM2O94759 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC35.75■■■■□ 3.31
TRPM2O94759 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
TRPM2O94759 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
TRPM2O94759 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
TRPM2O94759 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC35.74■■■■□ 3.31
TRPM2O94759 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC35.73■■■■□ 3.31
TRPM2O94759 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
TRPM2O94759 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
TRPM2O94759 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
TRPM2O94759 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
TRPM2O94759 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
TRPM2O94759 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC35.73■■■■□ 3.31
TRPM2O94759 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC35.73■■■■□ 3.31
TRPM2O94759 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.72■■■■□ 3.31
TRPM2O94759 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.72■■■■□ 3.31
TRPM2O94759 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.72■■■■□ 3.31
TRPM2O94759 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
TRPM2O94759 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
TRPM2O94759 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC35.72■■■■□ 3.31
TRPM2O94759 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
TRPM2O94759 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.71■■■■□ 3.31
TRPM2O94759 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC35.71■■■■□ 3.31
TRPM2O94759 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC35.71■■■■□ 3.31
TRPM2O94759 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
TRPM2O94759 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.69■■■■□ 3.3
TRPM2O94759 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
TRPM2O94759 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC35.69■■■■□ 3.3
TRPM2O94759 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC35.69■■■■□ 3.3
TRPM2O94759 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC35.69■■■■□ 3.3
TRPM2O94759 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC35.69■■■■□ 3.3
TRPM2O94759 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC35.69■■■■□ 3.3
TRPM2O94759 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC35.68■■■■□ 3.3
TRPM2O94759 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.68■■■■□ 3.3
TRPM2O94759 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
TRPM2O94759 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
TRPM2O94759 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC35.68■■■■□ 3.3
TRPM2O94759 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.67■■■■□ 3.3
TRPM2O94759 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
TRPM2O94759 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC35.67■■■■□ 3.3
TRPM2O94759 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.67■■■■□ 3.3
TRPM2O94759 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC35.66■■■■□ 3.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms