Protein–RNA interactions for Protein: O76031

CLPX, ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit clpX-like, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 633 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPXO76031 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLPXO76031 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLPXO76031 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLPXO76031 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CLPXO76031 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLPXO76031 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLPXO76031 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLPXO76031 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CLPXO76031 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLPXO76031 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLPXO76031 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLPXO76031 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLPXO76031 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLPXO76031 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLPXO76031 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLPXO76031 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLPXO76031 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLPXO76031 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLPXO76031 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLPXO76031 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLPXO76031 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CLPXO76031 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CLPXO76031 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLPXO76031 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLPXO76031 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLPXO76031 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLPXO76031 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLPXO76031 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLPXO76031 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLPXO76031 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLPXO76031 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLPXO76031 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLPXO76031 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLPXO76031 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLPXO76031 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLPXO76031 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLPXO76031 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLPXO76031 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLPXO76031 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLPXO76031 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLPXO76031 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLPXO76031 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLPXO76031 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLPXO76031 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLPXO76031 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLPXO76031 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLPXO76031 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLPXO76031 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLPXO76031 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLPXO76031 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLPXO76031 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLPXO76031 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CLPXO76031 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLPXO76031 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
CLPXO76031 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLPXO76031 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLPXO76031 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLPXO76031 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLPXO76031 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLPXO76031 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLPXO76031 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLPXO76031 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLPXO76031 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CLPXO76031 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLPXO76031 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLPXO76031 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLPXO76031 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLPXO76031 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLPXO76031 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLPXO76031 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLPXO76031 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLPXO76031 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLPXO76031 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CLPXO76031 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLPXO76031 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLPXO76031 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLPXO76031 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLPXO76031 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLPXO76031 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLPXO76031 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLPXO76031 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLPXO76031 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLPXO76031 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLPXO76031 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLPXO76031 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLPXO76031 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CLPXO76031 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLPXO76031 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLPXO76031 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
CLPXO76031 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CLPXO76031 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLPXO76031 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLPXO76031 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLPXO76031 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CLPXO76031 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLPXO76031 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLPXO76031 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLPXO76031 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLPXO76031 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLPXO76031 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms