Protein–RNA interactions for Protein: O75607

NPM3, Nucleoplasmin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPM3O75607 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
NPM3O75607 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
NPM3O75607 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
NPM3O75607 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
NPM3O75607 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
NPM3O75607 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
NPM3O75607 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
NPM3O75607 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
NPM3O75607 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
NPM3O75607 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
NPM3O75607 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
NPM3O75607 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
NPM3O75607 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
NPM3O75607 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
NPM3O75607 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
NPM3O75607 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC29.28■■■□□ 2.28
NPM3O75607 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
NPM3O75607 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
NPM3O75607 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
NPM3O75607 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
NPM3O75607 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
NPM3O75607 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
NPM3O75607 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
NPM3O75607 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
NPM3O75607 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
NPM3O75607 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC29.26■■■□□ 2.27
NPM3O75607 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
NPM3O75607 IFNA4-201ENST00000421715 978 ntAPPRIS P1 BASIC29.26■■■□□ 2.27
NPM3O75607 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
NPM3O75607 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
NPM3O75607 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
NPM3O75607 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
NPM3O75607 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
NPM3O75607 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
NPM3O75607 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
NPM3O75607 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
NPM3O75607 Z99916.3-201ENST00000623422 1080 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
NPM3O75607 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
NPM3O75607 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
NPM3O75607 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
NPM3O75607 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
NPM3O75607 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
NPM3O75607 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
NPM3O75607 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
NPM3O75607 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
NPM3O75607 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
NPM3O75607 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
NPM3O75607 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
NPM3O75607 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
NPM3O75607 AL035078.1-201ENST00000531962 820 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
NPM3O75607 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
NPM3O75607 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
NPM3O75607 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
NPM3O75607 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
NPM3O75607 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
NPM3O75607 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
NPM3O75607 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
NPM3O75607 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
NPM3O75607 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
NPM3O75607 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
NPM3O75607 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
NPM3O75607 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
NPM3O75607 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
NPM3O75607 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
NPM3O75607 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
NPM3O75607 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
NPM3O75607 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
NPM3O75607 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
NPM3O75607 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
NPM3O75607 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
NPM3O75607 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
NPM3O75607 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
NPM3O75607 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
NPM3O75607 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
NPM3O75607 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
NPM3O75607 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
NPM3O75607 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
NPM3O75607 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
NPM3O75607 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
NPM3O75607 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
NPM3O75607 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
NPM3O75607 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
NPM3O75607 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
NPM3O75607 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
NPM3O75607 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
NPM3O75607 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
NPM3O75607 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.25
NPM3O75607 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
NPM3O75607 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
NPM3O75607 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
NPM3O75607 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
NPM3O75607 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
NPM3O75607 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
NPM3O75607 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
NPM3O75607 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
NPM3O75607 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
NPM3O75607 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
NPM3O75607 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
NPM3O75607 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
NPM3O75607 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.5 ms