Protein–RNA interactions for Protein: O75436

VPS26A, Vacuolar protein sorting-associated protein 26A, humanhuman

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS26AO75436 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
VPS26AO75436 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
VPS26AO75436 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
VPS26AO75436 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
VPS26AO75436 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
VPS26AO75436 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
VPS26AO75436 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
VPS26AO75436 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
VPS26AO75436 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
VPS26AO75436 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
VPS26AO75436 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
VPS26AO75436 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
VPS26AO75436 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
VPS26AO75436 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
VPS26AO75436 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
VPS26AO75436 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
VPS26AO75436 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
VPS26AO75436 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
VPS26AO75436 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
VPS26AO75436 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
VPS26AO75436 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
VPS26AO75436 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
VPS26AO75436 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VPS26AO75436 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
VPS26AO75436 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VPS26AO75436 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
VPS26AO75436 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VPS26AO75436 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
VPS26AO75436 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VPS26AO75436 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VPS26AO75436 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VPS26AO75436 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VPS26AO75436 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VPS26AO75436 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
VPS26AO75436 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
VPS26AO75436 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
VPS26AO75436 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
VPS26AO75436 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
VPS26AO75436 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
VPS26AO75436 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
VPS26AO75436 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
VPS26AO75436 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
VPS26AO75436 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
VPS26AO75436 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
VPS26AO75436 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
VPS26AO75436 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
VPS26AO75436 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
VPS26AO75436 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
VPS26AO75436 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
VPS26AO75436 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
VPS26AO75436 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
VPS26AO75436 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
VPS26AO75436 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
VPS26AO75436 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
VPS26AO75436 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
VPS26AO75436 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
VPS26AO75436 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
VPS26AO75436 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
VPS26AO75436 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
VPS26AO75436 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
VPS26AO75436 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
VPS26AO75436 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
VPS26AO75436 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
VPS26AO75436 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
VPS26AO75436 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
VPS26AO75436 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
VPS26AO75436 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
VPS26AO75436 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
VPS26AO75436 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
VPS26AO75436 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
VPS26AO75436 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
VPS26AO75436 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
VPS26AO75436 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
VPS26AO75436 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
VPS26AO75436 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
VPS26AO75436 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
VPS26AO75436 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
VPS26AO75436 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
VPS26AO75436 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
VPS26AO75436 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
VPS26AO75436 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
VPS26AO75436 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
VPS26AO75436 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
VPS26AO75436 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
VPS26AO75436 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
VPS26AO75436 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
VPS26AO75436 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
VPS26AO75436 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
VPS26AO75436 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
VPS26AO75436 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
VPS26AO75436 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
VPS26AO75436 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
VPS26AO75436 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
VPS26AO75436 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
VPS26AO75436 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
VPS26AO75436 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
VPS26AO75436 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
VPS26AO75436 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
VPS26AO75436 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
VPS26AO75436 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.7 ms