Protein–RNA interactions for Protein: O60832

DKC1, H/ACA ribonucleoprotein complex subunit 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKC1O60832 C12orf57-207ENST00000545581 556 ntTSL 310.47□□□□□ -0.736e-7■■■■■ 56.4
DKC1O60832 C12orf57-205ENST00000542222 640 ntTSL 210.28□□□□□ -0.766e-7■■■■■ 56.4
DKC1O60832 DTX2P1-UPK3BP1-PMS2P11-202ENST00000584900 1636 ntTSL 219.5■□□□□ 0.714e-9■■■■■ 56.3
DKC1O60832 DTX2P1-UPK3BP1-PMS2P11-201ENST00000579700 1222 ntTSL 216.97■□□□□ 0.314e-9■■■■■ 56.3
DKC1O60832 DTX2P1-201ENST00000425797 1633 ntBASIC14.67□□□□□ -0.064e-9■■■■■ 56.3
DKC1O60832 DTX2P1-UPK3BP1-PMS2P11-203ENST00000636308 4646 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.174e-9■■■■■ 56.3
DKC1O60832 SNORA26-201ENST00000391286 122 ntBASIC0.49□□□□□ -2.331e-323■■■■■ 56.3
DKC1O60832 RABGEF1-211ENST00000503687 4139 ntTSL 213.72□□□□□ -0.215e-7■■■■■ 56.1
DKC1O60832 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.67e-9■■■■■ 56.1
DKC1O60832 PARD6G-202ENST00000463384 522 ntTSL 310.71□□□□□ -0.697e-9■■■■■ 56.1
DKC1O60832 TNS3-205ENST00000434451 560 ntTSL 518.68■□□□□ 0.582e-7■■■■■ 56
DKC1O60832 TNS3-206ENST00000442536 1166 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.52e-7■■■■■ 56
DKC1O60832 TNS3-209ENST00000458317 1156 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.292e-7■■■■■ 56
DKC1O60832 AAMDC-205ENST00000526164 726 ntTSL 217.76■□□□□ 0.435e-6■■■■■ 56
DKC1O60832 AAMDC-207ENST00000527134 693 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.145e-6■■■■■ 56
DKC1O60832 AAMDC-210ENST00000532481 690 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.255e-6■■■■■ 56
DKC1O60832 AAMDC-201ENST00000304716 619 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.425e-6■■■■■ 56
DKC1O60832 AAMDC-212ENST00000630098 542 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.515e-6■■■■■ 56
DKC1O60832 AAMDC-208ENST00000529666 440 ntTSL 37.44□□□□□ -1.225e-6■■■■■ 56
DKC1O60832 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.223e-10■■■■■ 56
DKC1O60832 SLC13A3-209ENST00000468915 1597 ntTSL 516.57■□□□□ 0.243e-10■■■■■ 56
DKC1O60832 SLC13A3-201ENST00000279027 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.373e-10■■■■■ 56
DKC1O60832 SLC13A3-210ENST00000472148 3283 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.713e-10■■■■■ 56
DKC1O60832 SLC13A3-202ENST00000290317 3994 ntTSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.053e-10■■■■■ 56
DKC1O60832 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.81e-323■■■■■ 56
DKC1O60832 DANCR-202ENST00000425653 823 ntTSL 1 (best)18.65■□□□□ 0.581e-323■■■■■ 56
DKC1O60832 LNPEP-201ENST00000231368 12752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.994e-6■■■■■ 55.9
DKC1O60832 ANKRD28-203ENST00000439830 592 ntTSL 528.3■■■□□ 2.122e-12■■■■■ 55.8
DKC1O60832 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.112e-12■■■■■ 55.8
DKC1O60832 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.412e-12■■■■■ 55.8
DKC1O60832 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.742e-12■■■■■ 55.8
DKC1O60832 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.712e-12■■■■■ 55.8
DKC1O60832 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.432e-12■■■■■ 55.8
DKC1O60832 LPIN1-213ENST00000464953 627 ntTSL 317.09■□□□□ 0.332e-12■■■■■ 55.8
DKC1O60832 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.012e-12■■■■■ 55.8
DKC1O60832 MICA-210ENST00000616296 2260 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.12e-12■■■■■ 55.8
DKC1O60832 MICA-208ENST00000421350 1005 ntTSL 512.71□□□□□ -0.372e-12■■■■■ 55.8
DKC1O60832 LPIN1-204ENST00000396099 3228 ntTSL 512.7□□□□□ -0.382e-12■■■■■ 55.8
DKC1O60832 LPIN1-209ENST00000449576 3077 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.442e-12■■■■■ 55.8
DKC1O60832 LPIN1-201ENST00000256720 5384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.62e-12■■■■■ 55.8
DKC1O60832 LPIN1-207ENST00000425416 5582 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.712e-12■■■■■ 55.8
DKC1O60832 LPIN1-205ENST00000404113 4005 ntTSL 1 (best)10.26□□□□□ -0.772e-12■■■■■ 55.8
DKC1O60832 LPIN1-202ENST00000396097 5690 ntTSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.942e-12■■■■■ 55.8
DKC1O60832 HCP5-201ENST00000414046 2658 ntTSL 4 BASIC8.87□□□□□ -0.992e-12■■■■■ 55.8
DKC1O60832 ANKRD28-204ENST00000451422 2485 ntTSL 28.04□□□□□ -1.122e-12■■■■■ 55.8
DKC1O60832 LPIN1-210ENST00000454151 583 ntTSL 36.95□□□□□ -1.32e-12■■■■■ 55.8
DKC1O60832 ANKRD28-212ENST00000497037 3509 ntTSL 25.23□□□□□ -1.572e-12■■■■■ 55.8
DKC1O60832 ANKRD28-202ENST00000412318 4408 ntTSL 24.94□□□□□ -1.622e-12■■■■■ 55.8
DKC1O60832 ANKRD28-215ENST00000624145 6383 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.692e-12■■■■■ 55.8
DKC1O60832 ANKRD28-213ENST00000498524 4289 ntTSL 24.41□□□□□ -1.72e-12■■■■■ 55.8
DKC1O60832 TFDP1-203ENST00000453989 792 ntTSL 326.81■■□□□ 1.888e-8■■■■■ 55.7
DKC1O60832 TFDP1-202ENST00000408980 866 ntTSL 525.46■■□□□ 1.678e-8■■■■■ 55.7
DKC1O60832 TFDP1-208ENST00000544902 1571 ntTSL 224.84■■□□□ 1.578e-8■■■■■ 55.7
DKC1O60832 TFDP1-206ENST00000475254 804 ntTSL 321■□□□□ 0.958e-8■■■■■ 55.7
DKC1O60832 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.088e-8■■■■■ 55.7
DKC1O60832 TFDP1-205ENST00000465174 955 ntTSL 315.09■□□□□ 0.018e-8■■■■■ 55.7
DKC1O60832 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.552e-7■■■■■ 55.7
DKC1O60832 C7orf50-208ENST00000491163 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 322.39■■□□□ 1.172e-7■■■■■ 55.7
DKC1O60832 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.072e-7■■■■■ 55.7
DKC1O60832 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.972e-7■■■■■ 55.7
DKC1O60832 C7orf50-207ENST00000488073 853 ntTSL 520.21■□□□□ 0.832e-7■■■■■ 55.7
DKC1O60832 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.758e-10■■■■■ 55.6
DKC1O60832 RUVBL1-203ENST00000472125 913 ntTSL 311.91□□□□□ -0.58e-10■■■■■ 55.6
DKC1O60832 RUVBL1-208ENST00000585057 1113 ntTSL 311.89□□□□□ -0.518e-10■■■■■ 55.6
DKC1O60832 RNU2-37P-201ENST00000410695 177 ntBASIC4.23□□□□□ -1.738e-10■■■■■ 55.6
DKC1O60832 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.449e-13■■■■■ 55.5
DKC1O60832 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.329e-13■■■■■ 55.5
DKC1O60832 ARHGAP27-206ENST00000527678 1070 ntTSL 520.2■□□□□ 0.829e-13■■■■■ 55.5
DKC1O60832 ARHGAP27-211ENST00000531735 4754 ntTSL 517.02■□□□□ 0.329e-13■■■■■ 55.5
DKC1O60832 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.655e-7■■■■■ 55.4
DKC1O60832 Z98883.1-201ENST00000409439 916 ntTSL 322.27■■□□□ 1.165e-7■■■■■ 55.4
DKC1O60832 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.075e-7■■■■■ 55.4
DKC1O60832 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.075e-7■■■■■ 55.4
DKC1O60832 PIGQ-202ENST00000293874 603 ntTSL 421.61■■□□□ 1.055e-7■■■■■ 55.4
DKC1O60832 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.995e-7■■■■■ 55.4
DKC1O60832 PIGQ-207ENST00000439574 586 ntTSL 320.88■□□□□ 0.935e-7■■■■■ 55.4
DKC1O60832 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.665e-7■■■■■ 55.4
DKC1O60832 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.395e-7■■■■■ 55.4
DKC1O60832 PIGQ-221ENST00000636657 2841 ntTSL 517.17■□□□□ 0.345e-7■■■■■ 55.4
DKC1O60832 PSKH1-201ENST00000291041 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.011e-10■■■■■ 55.4
DKC1O60832 FGFR4-216ENST00000514472 552 ntTSL 424.96■■□□□ 1.599e-19■■■■■ 55.2
DKC1O60832 FGFR4-214ENST00000513166 594 ntTSL 424.01■■□□□ 1.439e-19■■■■■ 55.2
DKC1O60832 FGFR4-209ENST00000507708 476 ntTSL 323.51■■□□□ 1.359e-19■■■■■ 55.2
DKC1O60832 FGFR4-212ENST00000510911 709 ntTSL 423.51■■□□□ 1.359e-19■■■■■ 55.2
DKC1O60832 FGFR4-204ENST00000426612 712 ntTSL 1 (best)23.22■■□□□ 1.319e-19■■■■■ 55.2
DKC1O60832 FGFR4-211ENST00000509511 1341 ntTSL 1 (best)22.1■■□□□ 1.139e-19■■■■■ 55.2
DKC1O60832 FGFR4-208ENST00000503708 770 ntTSL 421.01■□□□□ 0.959e-19■■■■■ 55.2
DKC1O60832 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.639e-19■■■■■ 55.2
DKC1O60832 FGFR4-205ENST00000430285 713 ntTSL 1 (best)18.96■□□□□ 0.639e-19■■■■■ 55.2
DKC1O60832 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.69e-19■■■■■ 55.2
DKC1O60832 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.69e-19■■■■■ 55.2
DKC1O60832 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.319e-19■■■■■ 55.2
DKC1O60832 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.075e-7■■■■■ 55.2
DKC1O60832 SBNO2-207ENST00000590176 561 ntTSL 421.32■■□□□ 15e-7■■■■■ 55.2
DKC1O60832 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.75e-7■■■■■ 55.2
DKC1O60832 INSR-205ENST00000598216 2961 ntTSL 1 (best)13.27□□□□□ -0.289e-11■■■■■ 55.2
DKC1O60832 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.241e-34■■■■■ 55.1
DKC1O60832 LONRF1-205ENST00000526680 2841 ntTSL 1 (best)11.34□□□□□ -0.591e-34■■■■■ 55.1
DKC1O60832 LONRF1-206ENST00000527055 769 ntTSL 29.33□□□□□ -0.921e-34■■■■■ 55.1
DKC1O60832 TNS3-207ENST00000450444 1832 ntTSL 514.41□□□□□ -0.12e-7■■■■■ 55.1
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