Protein–RNA interactions for Protein: O60779

SLC19A2, Thiamine transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC19A2O60779 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC19A2O60779 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC19A2O60779 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC19A2O60779 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC19A2O60779 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC19A2O60779 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC19A2O60779 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC19A2O60779 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC19A2O60779 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC19A2O60779 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC19A2O60779 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC19A2O60779 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC19A2O60779 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC19A2O60779 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC19A2O60779 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC19A2O60779 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC19A2O60779 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC19A2O60779 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC19A2O60779 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC19A2O60779 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC19A2O60779 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC19A2O60779 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC19A2O60779 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC19A2O60779 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC19A2O60779 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC19A2O60779 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC19A2O60779 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC19A2O60779 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC19A2O60779 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC19A2O60779 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC19A2O60779 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC19A2O60779 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC19A2O60779 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SLC19A2O60779 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SLC19A2O60779 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SLC19A2O60779 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SLC19A2O60779 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC19A2O60779 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC19A2O60779 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC19A2O60779 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC19A2O60779 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC19A2O60779 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC19A2O60779 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC19A2O60779 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC19A2O60779 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC19A2O60779 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC19A2O60779 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC19A2O60779 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC19A2O60779 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC19A2O60779 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC19A2O60779 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC19A2O60779 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC19A2O60779 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC19A2O60779 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC19A2O60779 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC19A2O60779 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC19A2O60779 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC19A2O60779 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC19A2O60779 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC19A2O60779 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC19A2O60779 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC19A2O60779 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC19A2O60779 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC19A2O60779 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC19A2O60779 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC19A2O60779 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC19A2O60779 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC19A2O60779 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC19A2O60779 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC19A2O60779 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC19A2O60779 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC19A2O60779 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC19A2O60779 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC19A2O60779 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC19A2O60779 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC19A2O60779 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC19A2O60779 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC19A2O60779 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC19A2O60779 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC19A2O60779 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC19A2O60779 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC19A2O60779 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC19A2O60779 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC19A2O60779 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC19A2O60779 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC19A2O60779 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC19A2O60779 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC19A2O60779 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC19A2O60779 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC19A2O60779 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC19A2O60779 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC19A2O60779 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC19A2O60779 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC19A2O60779 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC19A2O60779 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC19A2O60779 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC19A2O60779 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC19A2O60779 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC19A2O60779 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC19A2O60779 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms