Protein–RNA interactions for Protein: O43765

SGTA, Small glutamine-rich tetratricopeptide repeat-containing protein alpha, humanhuman

Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGTAO43765 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SGTAO43765 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SGTAO43765 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SGTAO43765 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SGTAO43765 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SGTAO43765 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SGTAO43765 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SGTAO43765 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SGTAO43765 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SGTAO43765 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SGTAO43765 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SGTAO43765 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SGTAO43765 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SGTAO43765 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SGTAO43765 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SGTAO43765 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SGTAO43765 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SGTAO43765 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SGTAO43765 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SGTAO43765 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SGTAO43765 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SGTAO43765 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SGTAO43765 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SGTAO43765 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SGTAO43765 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SGTAO43765 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SGTAO43765 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SGTAO43765 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SGTAO43765 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SGTAO43765 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SGTAO43765 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SGTAO43765 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SGTAO43765 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SGTAO43765 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SGTAO43765 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SGTAO43765 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SGTAO43765 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SGTAO43765 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SGTAO43765 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SGTAO43765 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SGTAO43765 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SGTAO43765 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SGTAO43765 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SGTAO43765 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SGTAO43765 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SGTAO43765 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SGTAO43765 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SGTAO43765 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SGTAO43765 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SGTAO43765 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SGTAO43765 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SGTAO43765 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SGTAO43765 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SGTAO43765 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SGTAO43765 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SGTAO43765 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SGTAO43765 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SGTAO43765 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SGTAO43765 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SGTAO43765 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SGTAO43765 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SGTAO43765 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SGTAO43765 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SGTAO43765 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SGTAO43765 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SGTAO43765 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SGTAO43765 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SGTAO43765 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SGTAO43765 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SGTAO43765 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SGTAO43765 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SGTAO43765 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SGTAO43765 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SGTAO43765 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SGTAO43765 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SGTAO43765 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SGTAO43765 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SGTAO43765 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SGTAO43765 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SGTAO43765 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SGTAO43765 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SGTAO43765 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SGTAO43765 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SGTAO43765 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SGTAO43765 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SGTAO43765 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SGTAO43765 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SGTAO43765 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SGTAO43765 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SGTAO43765 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SGTAO43765 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SGTAO43765 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SGTAO43765 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SGTAO43765 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SGTAO43765 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SGTAO43765 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SGTAO43765 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SGTAO43765 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SGTAO43765 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SGTAO43765 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms