Protein–RNA interactions for Protein: O43610

SPRY3, Protein sprouty homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRY3O43610 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SPRY3O43610 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SPRY3O43610 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SPRY3O43610 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SPRY3O43610 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SPRY3O43610 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SPRY3O43610 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
SPRY3O43610 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SPRY3O43610 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SPRY3O43610 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SPRY3O43610 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SPRY3O43610 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SPRY3O43610 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SPRY3O43610 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SPRY3O43610 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SPRY3O43610 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SPRY3O43610 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
SPRY3O43610 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SPRY3O43610 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SPRY3O43610 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SPRY3O43610 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SPRY3O43610 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SPRY3O43610 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
SPRY3O43610 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SPRY3O43610 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SPRY3O43610 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SPRY3O43610 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SPRY3O43610 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SPRY3O43610 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SPRY3O43610 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SPRY3O43610 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
SPRY3O43610 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SPRY3O43610 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SPRY3O43610 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SPRY3O43610 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SPRY3O43610 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SPRY3O43610 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SPRY3O43610 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SPRY3O43610 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SPRY3O43610 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SPRY3O43610 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SPRY3O43610 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SPRY3O43610 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SPRY3O43610 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SPRY3O43610 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SPRY3O43610 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SPRY3O43610 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SPRY3O43610 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SPRY3O43610 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SPRY3O43610 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SPRY3O43610 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
SPRY3O43610 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SPRY3O43610 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SPRY3O43610 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SPRY3O43610 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SPRY3O43610 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SPRY3O43610 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SPRY3O43610 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
SPRY3O43610 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SPRY3O43610 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SPRY3O43610 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SPRY3O43610 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SPRY3O43610 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SPRY3O43610 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SPRY3O43610 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SPRY3O43610 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SPRY3O43610 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
SPRY3O43610 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SPRY3O43610 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SPRY3O43610 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SPRY3O43610 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SPRY3O43610 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SPRY3O43610 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SPRY3O43610 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SPRY3O43610 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SPRY3O43610 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SPRY3O43610 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SPRY3O43610 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
SPRY3O43610 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
SPRY3O43610 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SPRY3O43610 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SPRY3O43610 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SPRY3O43610 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SPRY3O43610 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SPRY3O43610 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SPRY3O43610 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SPRY3O43610 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SPRY3O43610 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SPRY3O43610 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
SPRY3O43610 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SPRY3O43610 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SPRY3O43610 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SPRY3O43610 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SPRY3O43610 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SPRY3O43610 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SPRY3O43610 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SPRY3O43610 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
SPRY3O43610 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SPRY3O43610 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SPRY3O43610 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms