Protein–RNA interactions for Protein: O43497

CACNA1G, Voltage-dependent T-type calcium channel subunit alpha-1G, humanhuman

Predictions only

Length 2,377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1GO43497 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CACNA1GO43497 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CACNA1GO43497 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CACNA1GO43497 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CACNA1GO43497 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CACNA1GO43497 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CACNA1GO43497 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CACNA1GO43497 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CACNA1GO43497 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CACNA1GO43497 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CACNA1GO43497 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CACNA1GO43497 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CACNA1GO43497 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CACNA1GO43497 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CACNA1GO43497 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CACNA1GO43497 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CACNA1GO43497 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CACNA1GO43497 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CACNA1GO43497 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CACNA1GO43497 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CACNA1GO43497 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CACNA1GO43497 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CACNA1GO43497 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CACNA1GO43497 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CACNA1GO43497 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CACNA1GO43497 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CACNA1GO43497 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CACNA1GO43497 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CACNA1GO43497 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CACNA1GO43497 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CACNA1GO43497 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CACNA1GO43497 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CACNA1GO43497 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CACNA1GO43497 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CACNA1GO43497 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CACNA1GO43497 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CACNA1GO43497 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CACNA1GO43497 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CACNA1GO43497 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CACNA1GO43497 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CACNA1GO43497 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CACNA1GO43497 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CACNA1GO43497 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CACNA1GO43497 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CACNA1GO43497 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CACNA1GO43497 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CACNA1GO43497 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CACNA1GO43497 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CACNA1GO43497 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CACNA1GO43497 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CACNA1GO43497 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CACNA1GO43497 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CACNA1GO43497 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CACNA1GO43497 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CACNA1GO43497 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CACNA1GO43497 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CACNA1GO43497 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CACNA1GO43497 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CACNA1GO43497 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CACNA1GO43497 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CACNA1GO43497 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CACNA1GO43497 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CACNA1GO43497 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CACNA1GO43497 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CACNA1GO43497 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CACNA1GO43497 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CACNA1GO43497 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CACNA1GO43497 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CACNA1GO43497 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CACNA1GO43497 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CACNA1GO43497 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CACNA1GO43497 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CACNA1GO43497 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CACNA1GO43497 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CACNA1GO43497 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CACNA1GO43497 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CACNA1GO43497 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CACNA1GO43497 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CACNA1GO43497 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CACNA1GO43497 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CACNA1GO43497 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CACNA1GO43497 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CACNA1GO43497 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CACNA1GO43497 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CACNA1GO43497 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CACNA1GO43497 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CACNA1GO43497 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CACNA1GO43497 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CACNA1GO43497 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CACNA1GO43497 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CACNA1GO43497 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CACNA1GO43497 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CACNA1GO43497 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CACNA1GO43497 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CACNA1GO43497 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CACNA1GO43497 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CACNA1GO43497 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CACNA1GO43497 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CACNA1GO43497 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CACNA1GO43497 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.6 ms