Protein–RNA interactions for Protein: O43252

PAPSS1, Bifunctional 3'-phosphoadenosine 5'-phosphosulfate synthase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPSS1O43252 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PAPSS1O43252 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PAPSS1O43252 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PAPSS1O43252 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PAPSS1O43252 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PAPSS1O43252 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PAPSS1O43252 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PAPSS1O43252 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PAPSS1O43252 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PAPSS1O43252 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PAPSS1O43252 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PAPSS1O43252 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PAPSS1O43252 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PAPSS1O43252 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PAPSS1O43252 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PAPSS1O43252 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PAPSS1O43252 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PAPSS1O43252 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PAPSS1O43252 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PAPSS1O43252 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PAPSS1O43252 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PAPSS1O43252 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PAPSS1O43252 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PAPSS1O43252 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PAPSS1O43252 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PAPSS1O43252 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PAPSS1O43252 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PAPSS1O43252 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PAPSS1O43252 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
PAPSS1O43252 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PAPSS1O43252 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PAPSS1O43252 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PAPSS1O43252 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PAPSS1O43252 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PAPSS1O43252 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PAPSS1O43252 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PAPSS1O43252 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PAPSS1O43252 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PAPSS1O43252 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PAPSS1O43252 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PAPSS1O43252 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PAPSS1O43252 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PAPSS1O43252 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PAPSS1O43252 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PAPSS1O43252 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PAPSS1O43252 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PAPSS1O43252 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PAPSS1O43252 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PAPSS1O43252 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
PAPSS1O43252 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PAPSS1O43252 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PAPSS1O43252 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PAPSS1O43252 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PAPSS1O43252 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
PAPSS1O43252 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PAPSS1O43252 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PAPSS1O43252 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PAPSS1O43252 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PAPSS1O43252 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PAPSS1O43252 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PAPSS1O43252 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PAPSS1O43252 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PAPSS1O43252 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PAPSS1O43252 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PAPSS1O43252 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
PAPSS1O43252 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PAPSS1O43252 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PAPSS1O43252 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PAPSS1O43252 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PAPSS1O43252 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PAPSS1O43252 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PAPSS1O43252 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PAPSS1O43252 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PAPSS1O43252 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PAPSS1O43252 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PAPSS1O43252 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PAPSS1O43252 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PAPSS1O43252 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PAPSS1O43252 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PAPSS1O43252 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PAPSS1O43252 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PAPSS1O43252 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PAPSS1O43252 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PAPSS1O43252 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PAPSS1O43252 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PAPSS1O43252 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PAPSS1O43252 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PAPSS1O43252 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PAPSS1O43252 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PAPSS1O43252 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PAPSS1O43252 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PAPSS1O43252 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PAPSS1O43252 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PAPSS1O43252 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PAPSS1O43252 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PAPSS1O43252 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PAPSS1O43252 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PAPSS1O43252 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PAPSS1O43252 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PAPSS1O43252 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms