Protein–RNA interactions for Protein: O15335

CHAD, Chondroadherin, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHADO15335 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CHADO15335 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHADO15335 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHADO15335 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHADO15335 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHADO15335 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHADO15335 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHADO15335 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CHADO15335 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CHADO15335 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CHADO15335 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CHADO15335 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CHADO15335 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CHADO15335 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CHADO15335 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CHADO15335 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CHADO15335 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CHADO15335 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CHADO15335 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CHADO15335 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CHADO15335 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CHADO15335 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
CHADO15335 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
CHADO15335 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CHADO15335 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CHADO15335 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
CHADO15335 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
CHADO15335 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CHADO15335 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CHADO15335 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CHADO15335 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CHADO15335 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CHADO15335 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CHADO15335 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CHADO15335 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CHADO15335 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CHADO15335 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
CHADO15335 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CHADO15335 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CHADO15335 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CHADO15335 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CHADO15335 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CHADO15335 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CHADO15335 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CHADO15335 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CHADO15335 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CHADO15335 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CHADO15335 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CHADO15335 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CHADO15335 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CHADO15335 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CHADO15335 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CHADO15335 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CHADO15335 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CHADO15335 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CHADO15335 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CHADO15335 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CHADO15335 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CHADO15335 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CHADO15335 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CHADO15335 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CHADO15335 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CHADO15335 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
CHADO15335 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CHADO15335 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CHADO15335 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CHADO15335 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CHADO15335 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CHADO15335 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CHADO15335 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
CHADO15335 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CHADO15335 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CHADO15335 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CHADO15335 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CHADO15335 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CHADO15335 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CHADO15335 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CHADO15335 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CHADO15335 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CHADO15335 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CHADO15335 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CHADO15335 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CHADO15335 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CHADO15335 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CHADO15335 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CHADO15335 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CHADO15335 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CHADO15335 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CHADO15335 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CHADO15335 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CHADO15335 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CHADO15335 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CHADO15335 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.72
CHADO15335 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CHADO15335 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CHADO15335 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CHADO15335 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CHADO15335 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CHADO15335 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHADO15335 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms