Protein–RNA interactions for Protein: O15056

SYNJ2, Synaptojanin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,496 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNJ2O15056 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC40.98■■■■■ 4.15
SYNJ2O15056 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40.98■■■■■ 4.15
SYNJ2O15056 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.97■■■■■ 4.15
SYNJ2O15056 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.96■■■■■ 4.15
SYNJ2O15056 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.95■■■■■ 4.15
SYNJ2O15056 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC40.94■■■■■ 4.14
SYNJ2O15056 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.93■■■■■ 4.14
SYNJ2O15056 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.93■■■■■ 4.14
SYNJ2O15056 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC40.93■■■■■ 4.14
SYNJ2O15056 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC40.93■■■■■ 4.14
SYNJ2O15056 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.92■■■■■ 4.14
SYNJ2O15056 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.92■■■■■ 4.14
SYNJ2O15056 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.92■■■■■ 4.14
SYNJ2O15056 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC40.91■■■■■ 4.14
SYNJ2O15056 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC40.91■■■■■ 4.14
SYNJ2O15056 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.9■■■■■ 4.14
SYNJ2O15056 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.9■■■■■ 4.14
SYNJ2O15056 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC40.9■■■■■ 4.14
SYNJ2O15056 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC40.9■■■■■ 4.14
SYNJ2O15056 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.9■■■■■ 4.14
SYNJ2O15056 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC40.9■■■■■ 4.14
SYNJ2O15056 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.89■■■■■ 4.14
SYNJ2O15056 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.89■■■■■ 4.14
SYNJ2O15056 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.88■■■■■ 4.13
SYNJ2O15056 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC40.88■■■■■ 4.13
SYNJ2O15056 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC40.86■■■■■ 4.13
SYNJ2O15056 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.86■■■■■ 4.13
SYNJ2O15056 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.86■■■■■ 4.13
SYNJ2O15056 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.85■■■■■ 4.13
SYNJ2O15056 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC40.84■■■■■ 4.13
SYNJ2O15056 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC40.84■■■■■ 4.13
SYNJ2O15056 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC40.84■■■■■ 4.13
SYNJ2O15056 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.84■■■■■ 4.13
SYNJ2O15056 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC40.84■■■■■ 4.13
SYNJ2O15056 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC40.83■■■■■ 4.13
SYNJ2O15056 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC40.83■■■■■ 4.13
SYNJ2O15056 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC40.83■■■■■ 4.13
SYNJ2O15056 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC40.83■■■■■ 4.13
SYNJ2O15056 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.83■■■■■ 4.13
SYNJ2O15056 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.83■■■■■ 4.13
SYNJ2O15056 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.83■■■■■ 4.13
SYNJ2O15056 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC40.83■■■■■ 4.13
SYNJ2O15056 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC40.83■■■■■ 4.13
SYNJ2O15056 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC40.82■■■■■ 4.12
SYNJ2O15056 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC40.82■■■■■ 4.12
SYNJ2O15056 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.81■■■■■ 4.12
SYNJ2O15056 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.81■■■■■ 4.12
SYNJ2O15056 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC40.81■■■■■ 4.12
SYNJ2O15056 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.8■■■■■ 4.12
SYNJ2O15056 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC40.8■■■■■ 4.12
SYNJ2O15056 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC40.79■■■■■ 4.12
SYNJ2O15056 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.79■■■■■ 4.12
SYNJ2O15056 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.79■■■■■ 4.12
SYNJ2O15056 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC40.78■■■■■ 4.12
SYNJ2O15056 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC40.78■■■■■ 4.12
SYNJ2O15056 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.78■■■■■ 4.12
SYNJ2O15056 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.77■■■■■ 4.12
SYNJ2O15056 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.77■■■■■ 4.12
SYNJ2O15056 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.77■■■■■ 4.12
SYNJ2O15056 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC40.77■■■■■ 4.12
SYNJ2O15056 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC40.77■■■■■ 4.12
SYNJ2O15056 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC40.77■■■■■ 4.12
SYNJ2O15056 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.76■■■■■ 4.12
SYNJ2O15056 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC40.76■■■■■ 4.12
SYNJ2O15056 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC40.75■■■■■ 4.11
SYNJ2O15056 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC40.75■■■■■ 4.11
SYNJ2O15056 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC40.75■■■■■ 4.11
SYNJ2O15056 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC40.74■■■■■ 4.11
SYNJ2O15056 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC40.74■■■■■ 4.11
SYNJ2O15056 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.73■■■■■ 4.11
SYNJ2O15056 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.72■■■■■ 4.11
SYNJ2O15056 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.72■■■■■ 4.11
SYNJ2O15056 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC40.72■■■■■ 4.11
SYNJ2O15056 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC40.72■■■■■ 4.11
SYNJ2O15056 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC40.71■■■■■ 4.11
SYNJ2O15056 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.7■■■■■ 4.11
SYNJ2O15056 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.7■■■■■ 4.11
SYNJ2O15056 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.7■■■■■ 4.11
SYNJ2O15056 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.7■■■■■ 4.11
SYNJ2O15056 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC40.7■■■■■ 4.11
SYNJ2O15056 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC40.69■■■■■ 4.1
SYNJ2O15056 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.69■■■■■ 4.1
SYNJ2O15056 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC40.69■■■■■ 4.1
SYNJ2O15056 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC40.69■■■■■ 4.1
SYNJ2O15056 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC40.69■■■■■ 4.1
SYNJ2O15056 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC40.69■■■■■ 4.1
SYNJ2O15056 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC40.69■■■■■ 4.1
SYNJ2O15056 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC40.68■■■■■ 4.1
SYNJ2O15056 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC40.68■■■■■ 4.1
SYNJ2O15056 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.68■■■■■ 4.1
SYNJ2O15056 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC40.68■■■■■ 4.1
SYNJ2O15056 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC40.67■■■■■ 4.1
SYNJ2O15056 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.67■■■■■ 4.1
SYNJ2O15056 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC40.67■■■■■ 4.1
SYNJ2O15056 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.67■■■■■ 4.1
SYNJ2O15056 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.66■■■■■ 4.1
SYNJ2O15056 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.66■■■■■ 4.1
SYNJ2O15056 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC40.65■■■■■ 4.1
SYNJ2O15056 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC40.65■■■■■ 4.1
SYNJ2O15056 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC40.65■■■■■ 4.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms