Protein–RNA interactions for Protein: O14717

TRDMT1, tRNA (cytosine(38)-C(5))-methyltransferase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDMT1O14717 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRDMT1O14717 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRDMT1O14717 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRDMT1O14717 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRDMT1O14717 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRDMT1O14717 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRDMT1O14717 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRDMT1O14717 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRDMT1O14717 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRDMT1O14717 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRDMT1O14717 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRDMT1O14717 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRDMT1O14717 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRDMT1O14717 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRDMT1O14717 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRDMT1O14717 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRDMT1O14717 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRDMT1O14717 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRDMT1O14717 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRDMT1O14717 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRDMT1O14717 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRDMT1O14717 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRDMT1O14717 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRDMT1O14717 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRDMT1O14717 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRDMT1O14717 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRDMT1O14717 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRDMT1O14717 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRDMT1O14717 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRDMT1O14717 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRDMT1O14717 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRDMT1O14717 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRDMT1O14717 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRDMT1O14717 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
TRDMT1O14717 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRDMT1O14717 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRDMT1O14717 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRDMT1O14717 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRDMT1O14717 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRDMT1O14717 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRDMT1O14717 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRDMT1O14717 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRDMT1O14717 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRDMT1O14717 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRDMT1O14717 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRDMT1O14717 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRDMT1O14717 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRDMT1O14717 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRDMT1O14717 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
TRDMT1O14717 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
TRDMT1O14717 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
TRDMT1O14717 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRDMT1O14717 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRDMT1O14717 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRDMT1O14717 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRDMT1O14717 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRDMT1O14717 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRDMT1O14717 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRDMT1O14717 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
TRDMT1O14717 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRDMT1O14717 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRDMT1O14717 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
TRDMT1O14717 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRDMT1O14717 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRDMT1O14717 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRDMT1O14717 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRDMT1O14717 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
TRDMT1O14717 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRDMT1O14717 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRDMT1O14717 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRDMT1O14717 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
TRDMT1O14717 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRDMT1O14717 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
TRDMT1O14717 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TRDMT1O14717 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRDMT1O14717 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRDMT1O14717 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
TRDMT1O14717 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
TRDMT1O14717 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRDMT1O14717 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRDMT1O14717 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRDMT1O14717 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRDMT1O14717 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRDMT1O14717 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRDMT1O14717 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRDMT1O14717 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRDMT1O14717 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRDMT1O14717 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRDMT1O14717 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRDMT1O14717 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRDMT1O14717 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRDMT1O14717 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRDMT1O14717 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRDMT1O14717 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRDMT1O14717 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRDMT1O14717 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRDMT1O14717 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRDMT1O14717 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRDMT1O14717 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
TRDMT1O14717 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms